[发明专利]一种RAA荧光法检测广州管圆线虫的引物、探针和试剂盒在审
| 申请号: | 201911078249.3 | 申请日: | 2019-11-06 |
| 公开(公告)号: | CN110904196A | 公开(公告)日: | 2020-03-24 |
| 发明(设计)人: | 戴洋;张强;曹俊;刘剑峰;刘燕红;郭利川;王智宏;应清界 | 申请(专利权)人: | 江苏省血吸虫病防治研究所;江苏奇天基因生物科技有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/6844 | 分类号: | C12Q1/6844;C12Q1/6888;C12N15/11 |
| 代理公司: | 北京慕达星云知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 11465 | 代理人: | 王敏 |
| 地址: | 214064 江苏*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 raa 荧光 检测 广州 线虫 引物 探针 试剂盒 | ||
1.一种RAA荧光法检测广州管圆线虫的引物探针组合物,其特征在于,所述引物序列如下:
上游引物:5’-TACGATCGATGATGTAGTGGTGGGTGGGTGGTTG-3’;SEQ ID NO.1;
下游引物:5’-TAGCGACATAGCCGCCAAATTATCATCACCATC-3’;SEQ ID NO.2;
所述探针在SEQ ID NO.3所示序列的第31位碱基修饰荧光报告基团,第33位碱基修饰淬灭基团,第32位碱基修饰四氢呋喃残基;
5’-TGTGATCAACAACGAGAAACCACCAACACATATACACGTTCACCTAGT-3’;SEQ ID NO.3。
2.根据权利要求1所述的一种RAA荧光法检测广州管圆线虫的引物探针组合物,其特征在于,所述荧光报告基团包括FAM、HEX、TET、JOE、VIC、ROX、Cy3或Cy5。
3.根据权利要求1所述的一种RAA荧光法检测广州管圆线虫的引物探针组合物,其特征在于,所述淬灭基团包括TAMRA、Eclipse、BHQ1、BHQ2、BHQ3或DABCYL。
4.一种RAA荧光法检测广州管圆线虫的试剂盒,其特征在于,包括权利要求1~3任一项所述的引物探针组合物、RAA基础荧光通用反应试剂、反应缓冲液、阴性质控品、阳性质控品和临界阳性质控品。
5.根据权利要求4所述的一种RAA荧光法检测广州管圆线虫的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括引物探针组合物40~80μL,所述上游引物和下游引物的浓度分别为0.03~0.07mM,所述探针浓度为0.01~0.03mM;RAA基础荧光通用反应试剂24管冻干粉;反应缓冲液1000~1800μL;阴性质控品25~35μL;浓度为1.0×104~8copies/μL的阳性质控品;浓度为1.0×101~5copies/μL的临界阳性质控品。
6.根据权利要求4或5所述的一种RAA荧光法检测广州管圆线虫的试剂盒,其特征在于,所述阴性质控品为ddH2O。
7.根据权利要求6所述的一种RAA荧光法检测广州管圆线虫的试剂盒,其特征在于,所述阳性质控品和临界阳性质控品均为含有广州管圆线虫DNA片段的质粒;所述广州管圆线虫DNA片段的序列如SEQ ID NO.4所示。
8.根据权利要求7所述的一种RAA荧光法检测广州管圆线虫的试剂盒,其特征在于,所述反应缓冲液包括:450~550mM的Tris-HCl,200~300mM的MgAc和质量体积百分含量为5~15%的PEG10000。
9.根据权利要求8所述的一种RAA荧光法检测广州管圆线虫的试剂盒,其特征在于,所述RAA荧光法的反应体系为50μL;包括47μL反应缓冲液,2μL引物探针组合物,1μL样品、阴性质控品、阳性质控品或临界阳性质控品。
10.根据权利要求8所述的一种RAA荧光法检测广州管圆线虫的试剂盒,其特征在于,所述RAA荧光法的反应条件为:反应温度为25~42℃,反应时间为15~25min。
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