[发明专利]快速检测铁皮石斛中四种主要病原真菌引物组、试剂盒及方法在审
申请号: | 201911036640.7 | 申请日: | 2019-10-29 |
公开(公告)号: | CN110628938A | 公开(公告)日: | 2019-12-31 |
发明(设计)人: | 申屠旭萍;曹瑱艳;宋阳;俞晓平;许益鹏;刘光富 | 申请(专利权)人: | 中国计量大学 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6848;C12N15/11;C12R1/645 |
代理公司: | 33200 杭州求是专利事务所有限公司 | 代理人: | 郑海峰 |
地址: | 310018 浙江省*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 铁皮石斛 病原菌 检测 快速检测 引物组 病原真菌 传统平板 发育时期 多重PCR 病原体 多目标 分离法 检出限 试剂盒 病害 耗时 应用 表现 发现 | ||
1.快速检测铁皮石斛中四种主要病原真菌的引物组,其特征在于所述的引物组包括四对特异性引物对,每对特异性引物对的具体引物序列如下:
特异性引物对一:
正向引物Se-F:TACACCTGTGAACCAACTG;
反向引物Se-R:CATACAAGCTAGAATCCC;
特异性引物对二:
正向引物Cl-F:GGATGTTCATAACCCTTTG;
反向引物Cl-R:TAGCGAATAGTTTCCACAA;
特异性引物对三:
正向引物Co-F:GGCGGGTAGGGTCTCCGTGAC;
反向引物Co-R:TTTGAGGGCCTACATCAGCT;
特异性引物对四:
正向引物Al-F:GTCTTTTGCGTACTTCTTGTTT;
反向引物Al-R:GAACAGGCATGCCCTTTGGA。
2.一种快速检测铁皮石斛中四种主要病原真菌的试剂盒,其特征在于包括权利要求1所述的引物组。
3.如权利要求2所述的快速检测铁皮石斛中四种主要病原真菌的试剂盒,其特征在于还包括真菌通用引物对,其序列如下:
ITS1:TCCGTAGGTGAACCTGCGG;
ITS4:TCCTCCGCTTATTGATATGC。
4.一种快速检测铁皮石斛中四种主要病原真菌的方法,其特征在于包括如下步骤:
1)带病植株DNA的提取:
带病植物组织,于液氮中冷冻后打碎成粉末,提取其DNA;
2)巢氏多重PCR的扩增:
第一轮PCR使用真菌通用引物ITS1/ITS4扩增带病植株中病原真菌的ITS序列,其中ITS1序列如SEQ ID No.9所示,ITS4序列如SEQ ID No.10所示;
第二轮PCR使用第一轮PCR的产物作为模板,采用权利要求1中的引物组作为引物;
3)扩增结果的检测:
根据步骤2)扩增出的条带片段大小判断其对应的病原真菌;其中翠雀小核菌Sclerotiumdelphini目的片段大小为475bp;枝状枝孢菌Cladosporiumcladosporioides目的片段大小为393bp;胶孢炭疽菌Colletotorichumgloeosporioides目的片段大小为333bp;互隔交链孢菌Alternariaalternat目的片段大小为249bp。
5.如权利要求4所述的方法,其特征在于步骤1)中的DNA提取方法具体为:在打成粉末的植物组织中加入500μL 的CTAB溶液及CTAB溶液体积用量5%的β-巯基乙醇,于液氮内冷冻,再放入75℃水浴锅内融化2min,重复若干次,其中最后1次于75℃水浴锅内融化30min;接着加入500μL的DNA提取液,上下颠倒混匀,12000r/min离心10min,取上清液400μL,再重复上述步骤一次后加入800μL冰无水乙醇及5M的氯化钠溶液200μL沉淀1h,12000r/min离心10min,弃上清液,沉淀用70%乙醇洗涤两次,自然风干后用50μL ddH2O溶解DNA,-20℃保存备用;提取的DNA用分光光度计测量OD值,使OD260/280控制在1.8-2.0之间,用作后续PCR模板。
6.如权利要求4所述的方法,其特征在于步骤2)中第一轮PCR扩增体系及条件具体为:PCR反应为25μL体系,包括含Mg2+的10×buffer2μL,10mol/LdNTP 0.5μL,10μM/L引物ITS1/ITS43μL,2U/μLTaq polymerase0.4μL,DNA模板1μL,ddH2O 18.1μL;扩增条件为:94℃预变性2min,94℃变性45s,55℃退火30s,72℃延伸45s,共35个循环;最终72℃延伸10min。
7.如权利要求4所述的方法,其特征在于步骤2)中第二轮PCR扩增体系及条件具体为:PCR反应为25μL体系,包括含Mg2+的10×buffer 2μL,10mol/L dNTP 0.5μL,10μM/L引物Se-F/Se-R 1μL、Cl-F/Cl-R1μL、Co-F/Co-R 1.6μL、Al-F/Al-R3.2μL、2U/μLTaq polymerase0.4μL,DNA模板1μL,ddH2O 14.3μL;扩增条件为:94℃预变性2min,94℃变性45s,55℃退火30s,72℃延伸45s,共20个循环;最终72℃延伸8min。
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