[发明专利]RXRA基因的多态性在抗结核病药物不良反应中的应用在审
申请号: | 201910937829.7 | 申请日: | 2019-09-30 |
公开(公告)号: | CN110577992A | 公开(公告)日: | 2019-12-17 |
发明(设计)人: | 焦琳 | 申请(专利权)人: | 四川大学华西医院 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883 |
代理公司: | 11463 北京超凡宏宇专利代理事务所(特殊普通合伙) | 代理人: | 周文波 |
地址: | 610000 四*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 多态性 结核病 基因 抗结核药物治疗 抗结核病药物 结核病药物 抗结核药物 筛查 应用 检测 预测 治疗 发现 | ||
1.检测试剂在制备试剂或试剂盒中的应用,其特征在于,所述试剂或试剂盒用于预测结核病患者接受抗结核药物治疗产生不良反应的风险;所述检测试剂用于检测RXRA基因在如下SNP位点中的任意一种位点的基因型:rs55735339和rs59211076。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述不良反应为选自肝损害;
优选地,所述结核病患者为活动性结核病患者;
优选地,所述抗结核药物选自如下治疗方案中的任意一种治疗方案的药物:HRZE、HREO、HLZE和D1321ThOk。
3.根据权利要求1-2任一项所述的应用,其特征在于,所述检测试剂适用于采用如下方法中的任意一种进行检测:
限制性片段长度多态性分析、单链构象多态性、PCR-ASO探针法、PCR-SSO法、PCR-SSP法、PCR-荧光法、PCR-DNA测序法、直接测序法、PCR指纹图法、基因芯片法、AFLP、DGGE、RAPD和单碱基延伸终止法;
优选地,所述检测试剂适用于采用单碱基延伸终止法进行检测;
优选地,所述检测试剂包括如下(1)-(2)所示核酸组中的至少一种:
(1):用于检测rs55735339位点基因型的第一核酸组,其包括SEQ ID NO.1-3所示的核酸分子;
(2):用于检测rs59211076位点基因型的第二核酸组,其包括SEQ ID NO.4-6所示的核酸分子。
4.一种用于预测结核病患者接受抗结核药物治疗产生不良反应的风险的试剂,其特征在于,所述试剂包括用于检测RXRA基因在如下SNP位点中的任意一种位点的基因型:rs55735339和rs59211076的检测试剂。
5.根据权利要求4所述的试剂,其特征在于,所述检测试剂适用于采用如下方法中的任意一种进行检测:
限制性片段长度多态性分析、单链构象多态性、PCR-ASO探针法、PCR-SSO法、PCR-SSP法、PCR-荧光法、PCR-DNA测序法、直接测序法、PCR指纹图法、基因芯片法、AFLP、DGGE、RAPD和单碱基延伸终止法;
优选地,所述检测试剂适用于采用单碱基延伸终止法进行检测;
优选地,所述检测试剂包括如下(1)-(2)所示核酸组中的至少一种:
(1):用于检测rs55735339位点基因型的第一核酸组,其包括SEQ ID NO.1-3所示的核酸分子;
(2):用于检测rs59211076位点基因型的第二核酸组,其包括SEQ ID NO.4-6所示的核酸分子。
6.一种用于预测结核病患者接受抗结核药物治疗产生不良反应的风险的试剂盒,其特征在于,其包括权利要求4或5所述的试剂。
7.根据权利要求6所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括如下试剂中的一种或几种:基因组DNA提取试剂、PCR反应缓冲液、DNA聚合酶、dNTPs和单碱基延伸反应试剂。
8.一种检测RXRA基因上SNP位点基因型的方法,该方法以非疾病的诊断为目的,其特征在于,其包括:检测RXRA基因在如下SNP位点中的任意一种位点的基因型:rs55735339和rs59211076。
9.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,采用如下方法中的任意一种进行检测:限制性片段长度多态性分析、单链构象多态性、PCR-ASO探针法、PCR-SSO法、PCR-SSP法、PCR-荧光法、PCR-DNA测序法、直接测序法、PCR指纹图法、基因芯片法、AFLP、DGGE、RAPD和单碱基延伸终止法;
优选地,采用单碱基延伸终止法进行检测;
优选地,采用如下(1)-(2)所示核酸组中的至少一种进行检测:
(1):用于检测rs55735339位点基因型的第一核酸组,其包括SEQ ID NO.1-3所示的核酸分子;
(2):用于检测rs59211076位点基因型的第二核酸组,其包括SEQ ID NO.4-6所示的核酸分子。
10.根据权利要求9所述的方法,其特征在于,所述方法包括如下(a)或(b):
(a):使用SEQ ID NO.1-2所示的核酸分子扩增核酸样品,得到扩增产物,使用SEQ IDNO.3所示的核酸分子与所述扩增产物混合,进行单碱基延伸反应;
(b):使用SEQ ID NO.4-5所示的核酸分子扩增核酸样品,得到扩增产物,使用SEQ IDNO.6所示的核酸分子与所述扩增产物混合,进行单碱基延伸反应;
优选地,所述核酸样品为基因组DNA。
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