[发明专利]一种与玉米籽粒产量及品质相关的分子标记

说明书

本发明公开了一种与玉米籽粒产量及品质相关的分子标记。本发明公开的分子标记(chr3.S_215018483)为玉米基因组中对应于序列表中序列3的第189位的核苷酸，该分子标记为T或C。玉米中，两条染色体的chr3.S_215018483均为T的TT基因型玉米籽粒的粒长和百粒重均低于两条染色体的chr3.S_215018483均为C的CC基因型玉米，TT基因型玉米籽粒的二十酸含量高于CC基因型玉米；TT基因型玉米籽粒的亚油酸含量低于CC基因型玉米。在育种中可以选择CC基因型的玉米作为亲本进行育种，以提高籽粒相关性状—粒长和百粒重以及提高玉米籽粒亚油酸含量。

技术领域

本发明涉及生物技术领域中，一种与玉米籽粒产量及品质相关的分子标记。

背景技术

玉米(Zea mays L.)是粮、经、饲兼用的高产粮食作物。玉米生产在保障全球粮食安全方面具有重要作用。随着世界人口的持续增加，人类对粮食的需求将与日俱增。但在当前耕地面积持续减少的形式下，提高单产水平成为解决玉米供需矛盾的根本途径。籽粒是玉米生产过程中的主要收获目标，而不断增加籽粒产量是玉米高产育种的最终目标。籽粒重量的基本的玉米产量三要素之一(粒重、穗粒数、亩穗数)。因此，籽粒大小(如长、宽、重量等)对玉米产量水平的提高至关重要。尽管玉米籽粒大小的遗传结构复杂，受多个基因位点控制，但玉米籽粒大小遗传力高，且存在控制籽粒大小的主效基因。同时，随着社会生产需求的不断变化，籽粒营养品质受到越来越多的重视，而玉米的产量性状和营养品质性状之间存在复杂的关系，在此条件下，挖掘并鉴定出与籽粒大小及营养品质相关的优良等位变异，并且开发相应等位变异的分子标记，对玉米高产优质育种过程中的分子标记辅助具有重要的生产应用价值。

单核甘酸多态性(Single nucleotide polymorphism，SNP)是指在基因组水平上由单个核苷酸变异所引起的DNA序列的多态性。随着基因组重测序技术的发展及其成本的大幅降低，SNP分子标记检测经济高效，成为当前新一代分子标记类型之一，已被应用于玉米遗传图谱的构建、玉米重要农艺性状相关基因的定位和基因组关联分析等方面。

发明内容

本发明的目的是提供一种与玉米籽粒产量及品质相关性状相关的分子标记。

为解决上述技术问题，本发明首先提供了玉米分子标记或检测所述玉米分子标记的物质在检测或辅助检测玉米产量相关性状或品质相关性状中的应用；

所述玉米分子标记为a1)或a2)：

a1)玉米基因组中对应于序列表中序列3的第189位的核苷酸，所述玉米分子标记为T或C；

a2)含有a1)所述玉米分子标记的DNA片段。

上述应用中，所述检测所述玉米分子标记的物质可为引物对，所述引物对满足：在以玉米基因组为模板利用所述引物对进行PCR扩增时，得到的扩增产物中含有所述玉米分子标记。

所述引物对可为A1，所述A1由名称分别为P1和P2的单链DNA组成，所述P1为序列表中序列1所示的单链DNA，所述P2为序列表中序列2所示的单链DNA。

所述玉米分子标记可为序列表中序列3或4所示的DNA片段。

所述玉米基因组可为玉米的基因组DNA或转录组。所述转录组可为玉米总RNA或以玉米总RNA反转录得到的cDNA。所述玉米总RNA通过提取玉米整株或其部分组织的RNA得到。所述玉米总RNA具体可通过提取玉米成熟或未成熟籽粒的RNA得到。

上述应用中，所述玉米产量相关性状可为玉米籽粒粒长和/或玉米籽粒粒重，所述品质相关性状可为玉米籽粒亚油酸含量和/或玉米籽粒二十酸含量。

所述粒重可体现在百粒重上。