[发明专利]肺癌甲基化和结直肠癌甲基化判断装置

权利要求书

1.一种肺癌甲基化判断装置，其特征在于，包括：采集模块、差值计算模块、甲基化预判模块和甲基化判断模块；其中，

所述采集模块用于从荧光定量PCR反应过程中采集荧光通道内参的第一Ct值，RASSF1A基因的第二Ct值以及SHOX2基因的第三Ct值；

所述差值计算模块用于求取第二Ct值与第一Ct值之间的第一差值，以及第三Ct值与第一Ct值之间的第二差值；

所述甲基化预判模块，用于根据所述采集模块采集的结果和所述差值计算模块求取的结果预判肺癌甲基化阳性或肺癌甲基化非阳性；

所述甲基化判断模块，用于根据预判的肺癌甲基化阳性或肺癌甲基化非阳性的结果以及第一Ct值，判断肺癌甲基化阳性或者阴性。

2.根据权利要求1所述的肺癌甲基化判断装置，其特征在于：所述RASSF1A基因的第二Ct值是来自于FAM通道；SHOX2基因的第三Ct值是来自于VIC通道或HEX通道；内参的第一Ct值来自于CY5通道。。

3.根据权利要求1所述的肺癌甲基化判断装置，其特征在于：所述甲基化预判模块包括RASSF1A基因甲基化判定子模块、SHOX2基因甲基化判定子模块和预判子模块，其中，

所述RASSF1A基因甲基化判定子模块用于判断RASSF1A基因甲基化的阴性或阳性；

所述SHOX2基因甲基化判定子模块用于判断SHOX2基因甲基化的阴性或者阳性；

所述预判子模块用于根据RASSF1A基因甲基化的判定结果和SHOX2基因甲基化的判定结果预判肺癌甲基化阳性或肺癌甲基化非阳性。

4.根据权利要求3所述的肺癌甲基化判断装置，其特征在于：所述RASSF1A基因甲基化判定子模块用于按照如下条件对RASSF1A基因甲基化的阴性或阳性进行判断的：

当第二Ct值小于35，且第一差值小于等于13，则判断RASSF1A基因甲基化阳性；

当第二Ct值大于等于35，或者第二Ct值小于35，且第一差值大于13，则判断RASSF1A基因甲基化阴性。

5.根据权利要求3所述的肺癌甲基化判断装置，其特征在于：所述SHOX2基因甲基化判定子模块用于按照如下条件对SHOX2基因甲基化的阴性或阳性进行判断的：

当第三Ct值小于32，且第二差值小于等于9，则判断SHOX2基因甲基化阳性；

当第三Ct值大于等于32，或者第三Ct值小于32，且第二差值大于9，则判断SHOX2基因甲基化阴性。

6.根据权利要求3所述的肺癌甲基化判断装置，其特征在于：所述预判子模块用于按照如下条件预判肺癌甲基化阳性或肺癌甲基化非阳性：

当RASSF1A基因甲基化阳性或SHOX2基因甲基化阳性，则预判肺癌甲基化阳性；

否则，预判肺癌甲基化非阳性。

7.根据权利要求1所述的肺癌甲基化判断装置，其特征在于：所述甲基化判断模块用于按照如下条件进行判断：

当预判甲基化阳性，第一Ct值大于等于18且小于32时，则判断肺癌甲基化阳性；

当预判甲基化非阳性，第一Ct值大于等于18且小于21时，则判断肺癌甲基化阴性，

当预判甲基化非阳性，第一Ct值大于等于21且小于23时，则判断肺癌甲基化阴性，样本DNA投入量不够。

8.根据权利要求1所述的肺癌甲基化判断装置，其特征在于：所述甲基化判断模块还用于进行如下判断：

当预判肺癌甲基化阳性，第一Ct值小于18时，则判断样本DNA需稀释后重新检测，其中，稀释倍数为2^(20-第一Ct值)；

当预判肺癌甲基化阳性，第一Ct值大于等于32时，判断内参扩增失败，需修饰样本DNA后重新检测；

当预判肺癌甲基化非阳性，第一Ct值小于18时，则判断样本DNA需稀释后重新检测，其中，稀释倍数为2^(20-第一Ct值)；

当预判肺癌甲基化非阳性，第一Ct值大于等于23时，则判断检测结果无效，需增加样本DNA投入量重新检测或重新采样。