[发明专利]检测免疫相关基因表达量的试剂的应用、试剂盒和头颈癌预后风险预测装置

说明书

本发明公开了检测免疫相关基因表达量的试剂的应用、试剂盒和头颈癌预后风险预测装置，涉及生物医学领域。本发明公开了检测免疫相关基因表达量的试剂在头颈癌预后风险的应用，免疫相关基因选自如下基因：RFXAP、ULBP1、TMSB4Y、RBP4、LCNL1、CCR6、KLRK1、PTX3、MASP1、HRG、CCL22、OLR1、ROBO1、BTC、CHGB、DKK1、HBEGF、INHBB、PDGFA、AVPR2、IL20RA、RORB、TNFRSF18、TNFRSF25、TNFRSF4、SH3BP2以及ICOS。根据这些免疫相关基因的表达量数据，预测头颈癌预后风险，具有良好特异性和灵敏度。

技术领域

本发明涉及生物医学领域，具体而言，涉及检测免疫相关基因表达量的试剂的应用、试剂盒和头颈癌预后风险预测装置。

背景技术

头颈癌(head and neck cancer，HNC)是全球常见癌症之一，最常见的病理类型是头颈部鳞状细胞癌(head and neck squamous cell carcinoma，HNSCC)，每年全球有超过60万新增病例。虽然新治疗方案层出不穷，但是其5年生存率大约只有60％，每年全球大约有38万人因此病死亡。死亡的重要原因是局部肿瘤的复发，对于有肿瘤复发及转移的患者，一线化疗中位总生存期(overall survival,OS)仅为10至13个月，二线化疗中位OS为6个月。手术治疗作为一线方案，但是按照传统临床特征定义为同一类型的患者，治疗后的预后效果也有很大区别。近年来研究认为这主要是有癌症患者的分子异质性导致。

基因分子标志物，是指基于一组基因的表达，通过机器学习建立数学模型，用于预测临床上的具体问题。近年来基因表达检测手段已经相当成熟，包括高通量的RNA测序技术、微阵列技术(Microarray)，以及相对低通量的实时定量聚合酶链式反应(RT-qPCR)和NanoString技术等。但是，目前用于头颈癌预后预测的研究较少，缺乏可以较好预测头颈癌预后风险的基因、试剂、试剂盒等产品和方法。

鉴于此，特提出本发明。

发明内容

本发明的目的在于提供检测免疫相关基因表达量的试剂的应用、试剂盒和头颈癌预后风险预测装置，以实现对头颈癌预后风险的预测。

本发明是这样实现的：

第一方面，本发明提供了检测免疫相关基因表达量的试剂在制备预测头颈癌预后风险的试剂盒中的应用，上述免疫相关基因选自如下基因中的一种或多种的组合：RFXAP、ULBP1、TMSB4Y、RBP4、LCNL1、CCR6、KLRK1、PTX3、MASP1、HRG、CCL22、OLR1、ROBO1、BTC、CHGB、DKK1、HBEGF、INHBB、PDGFA、AVPR2、IL20RA、RORB、TNFRSF18、TNFRSF25、TNFRSF4、SH3BP2以及ICOS。

进一步地，在本发明的一些实施方案中，所述免疫相关基因选自如下基因中的一种或多种的组合：BTC、CHGB、HBEGF、DKK1、RFXAP、RBP4、TNFRSF25、TNFRSF4、LCNL1、CCL22、IL20RA、TNFRSF18、KLRK1、TMSB4Y以及MASP1。

本发明的研究发现，免疫相关基因如RFXAP、ULBP1、TMSB4Y、RBP4、LCNL1、CCR6、KLRK1、PTX3、MASP1、HRG、CCL22、OLR1、ROBO1、BTC、CHGB、DKK1、HBEGF、INHBB、PDGFA、AVPR2、IL20RA、RORB、TNFRSF18、TNFRSF25、TNFRSF4、SH3BP2以及ICOS在不同头颈癌患者之间的表达有显著差异，这些免疫相关基因可以作为稳定预测头颈癌预后的特征基因，根据这些免疫相关基因的表达量数据，预测头颈癌预后风险，具有良好特异性和灵敏度，预测效果较好，如3年AUC可达0.782。因此，检测这些免疫相关基因的表达量的试剂可以用于制备预测头颈癌预后风险的试剂盒。