[发明专利]一种与小麦每穗小穗数相关的SNP位点及其应用有效
| 申请号： | 201910555932.5 | 申请日： | 2019-06-25 |
| 公开（公告）号： | CN110184381B | 公开（公告）日： | 2023-07-25 |
| 发明（设计）人： | 刘西岗;李永鹏;赵美丞;郭鑫鑫;景蕊莲 | 申请（专利权）人： | 中国科学院遗传与发育生物学研究所农业资源研究中心 |
| 主分类号： | C12Q1/6895 | 分类号： | C12Q1/6895;C12N15/11 |
| 代理公司： | 北京众合诚成知识产权代理有限公司 11246 | 代理人： | 张鹏 |
| 地址： | 050022 *** | 国省代码： | 河北;13 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 一种 小麦 小穗 相关 snp 及其 应用 | ||
1.一种鉴定与小麦每穗小穗数相关SNP位点的引物组，其特征在于，所述的SNP位点对应于SEQ ID NO.1所示序列自5’末端第1501位碱基，该位点为A/A纯合时，相对应的基因型是甲；该位点为G/G纯合时，相对应的基因型是乙；
所述引物组为SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3组成的引物对1F和1R，和SEQ ID NO.4和SEQID NO.5组成的引物对2F和2R。
2.一种鉴定或辅助鉴定小麦每穗小穗数性状的方法，其特征在于，包括对待测小麦基因组DNA中包含权利要求1所述SNP位点在内的DNA片段进行PCR扩增，并将该PCR扩增产物进行酶切鉴定；
所述的PCR扩增的DNA片段为SEQ ID NO.1中5’末端1367-1525bp；所述的PCR扩增的特异性引物对为SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3组成的引物对1F和1R，SEQ ID NO.4和SEQ IDNO.5组成的引物对2F和2R；
所述的酶切包括以下步骤：以小麦基因组DNA为模板，以引物1F和1R为引物对扩增得到PCR产物；将此PCR产物稀释100倍，以其作为模板，以引物2F和2R为引物对扩增得到PCR产物；用限制性内切酶HinfI酶切PCR产物；若PCR产物可以被切开，则该核苷酸多态性位点为A/A，基因型为甲；若PCR产物不能被切开，则该核苷酸多态性位点为G/G，基因型为乙，基因型为甲的小麦的小麦每穗小穗数大于基因型为乙的小麦的小麦每穗小穗数。
3.权利要求1所述的引物组在鉴定或辅助鉴定小麦每穗小穗数性状中的应用，所述引物组用于检测权利要求1所述SNP位点，所述的SNP位点为A/A纯合时，相对应的基因型是甲；所述的SNP位点为G/G纯合时，相对应的基因型是乙，基因型为甲的小麦的小麦每穗小穗数大于基因型为乙的小麦的小麦每穗小穗数。
4.一种鉴别或辅助鉴别小麦每穗小穗数性状的试剂或试剂盒，其特征在于，所述的试剂或试剂盒包括权利要求1所述引物组。
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