[发明专利]一种基于G-四链体探针结构解旋的可视化识别microRNA的检测方法有效
| 申请号: | 201910514343.2 | 申请日: | 2019-06-14 |
| 公开(公告)号: | CN110229872B | 公开(公告)日: | 2020-11-10 |
| 发明(设计)人: | 程靓;兰玲;刘利 | 申请(专利权)人: | 中国科学院化学研究所 |
| 主分类号: | C12Q1/6816 | 分类号: | C12Q1/6816 |
| 代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 秦梦楠 |
| 地址: | 100190 *** | 国省代码: | 北京;11 |
| 权利要求书: | 查看更多 | 说明书: | 查看更多 |
| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 基于 四链体 探针 结构 可视化 识别 microrna 检测 方法 | ||
1.一种检测microRNA的方法,包括如下步骤:合成探针;所述探针由结合区段和信号区段组成;所述结合区段为与目标microRNA的全长序列反向互补的DNA片段;所述信号区段为可形成G-四链体结构的DNA片段;
如果所述探针与待测样本进行DNA/RNA杂化反应后可以招募DNA聚合酶对探针的G-四链体结构进行解旋复制使其转变为双链结构,则待测样本中含有目标microRNA;反之,待测样本中不含有目标microRNA;
所述方法为非疾病诊断的方法。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于:
所述方法包括如下步骤:
(1)合成权利要求1中所述的探针;
(2)取步骤(1)所述探针,经过退火使所述探针的信号区段形成G-四链体结构;
(3)将步骤(2)的探针与待测样本进行DNA/RNA杂化反应;
(4)完成步骤(3)后,向反应体系中加入DNA聚合酶进行解旋扩增反应;
(5)完成步骤(4)后,向反应体系中加入血红素进行反应;血红素可与未解旋的G-四链体结构结合形成具有催化功能的复合物;
(6)完成步骤(5)后,向反应体系中加入ABTS和H2O2进行催化反应后检测420nm处吸收值;
所述方法设置空白对照;所述空白对照采用水替代待测样本;将待测样本在420nm处吸收值记为A,将空白对照在420nm处吸收值记为A0;A0-A的数值越大,待测样本中目标miRNA的含量越多。
3.如权利要求1或2所述的方法,其特征在于:
当选用的DNA聚合酶的复制方向是3′→5′时,所述探针自5’端至3’端依次为信号区段和结合区段;当选用的DNA聚合酶的复制方向是5′→3′时,所述探针自5’端至3’端依次为结合区段和信号区段。
4.如权利要求1或2所述的方法,其特征在于:所述探针的信号区段的长度小于30bp;所述信号区段形成G-四链体结构时,四联体层数小于等于3。
5.如权利要求1或2所述的方法,其特征在于:所述信号区段如序列表的序列1自5’端第1至19位所示。
6.如权利要求1或2所述的方法,其特征在于:所述DNA聚合酶为Klenow Fragment聚合酶。
7.如权利要求2所述的方法,其特征在于:
所述步骤(3)中,所述探针在DNA/RNA杂化反应体系中的浓度为0.5-1μmol/L;
和/或,所述杂化反应温度为20℃-37℃;
和/或,所述杂化反应时间为60-120min;
所述步骤(4)中,所述DNA聚合酶在解旋扩增反应体系中的浓度为0.1-0.3unit/μL;
和/或,所述解旋扩增反应时间为40-60min;
所述步骤(5)中,所述血红素在反应体系中的浓度为2-4μmol/L;
和/或,所述反应时间为1-2h;
和/或,所述反应温度为20℃-37℃。
8.权利要求1至5中任一所述方法中的所述探针在制备试剂盒中的应用;所述试剂盒的用途为检测目标microRNA。
9.一种检测microRNA的试剂盒,含有权利要求1至5中任一所述方法中的所述探针。
10.如权利要求9所述的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒还含有记载权利要求1至7任一所述方法的说明书。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于中国科学院化学研究所,未经中国科学院化学研究所许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服】
本文链接:http://www.vipzhuanli.com/pat/books/201910514343.2/1.html,转载请声明来源钻瓜专利网。





