[发明专利]位于猪7号染色体上与总乳头数相关的SNP分子标记及应用

说明书

本发明属于分子生物技术和分子标记技术领域，具体涉及一种位于猪7号染色体上与总乳头数相关的SNP分子标记及应用。所述的位于猪7号染色体上与总乳头数相关的SNP分子标记的SNP位点对应于国际猪基因组11.1版本参考序列7号染色体上第97568284位GA突变；本发明还提供了一种用于上述位于猪7号染色体上与总乳头数相关的SNP分子标记的引物对。本发明通过优选该SNP的优势等位基因，能够逐代增加优势等位基因频率，提高猪的繁殖性能，加快猪遗传改良进展从而有效提高经济效益。

技术领域

本发明属于分子生物技术和分子标记技术领域，具体涉及一种位于猪7号染色体上与总乳头数相关的SNP分子标记及应用。

背景技术

母猪的乳头是仔猪在哺乳期获取营养和免疫力的重要器官。近年来，对增加窝产仔猪数的选育加剧了母猪饲喂更多仔猪的负担。因此，使猪拥有足够数量的乳头一直是种猪选育的重要目标。总乳头数(total teat number，TTN)是猪重要的繁殖性状，增加总乳头数是提高仔猪存活率、促进仔猪体重增加以及均匀生长的重要手段。因此，对总乳头数性状的选育十分必要，以提高猪生产性能。

母猪繁殖性能对猪场的生产效益有着重要的影响，而总乳头数是评价种猪繁殖性能的重要指标之一。充足的乳头数才能实现仔猪多产多活的需求，与仔猪的生长发育和免疫健康也密切相关。乳头数为中高等遗传力性状，遗传力在0.20～0.40之间，然而在实际生产工作中，育种工作者往往从表型上直接对乳头数进行选择，简单的淘汰与留种选择并不能满足生产需要，且未充分发挥猪的生产潜能。因此，采用遗传手段对核心猪群总乳头数进行性状改良，则能加快目标性状的选育进展。这不仅有利于充分挖掘猪繁殖性能还能提高仔猪存活率和生长性能，进而提高经济效益，增强商品猪生产的竞争力。

乳头数是典型的由多基因控制的数量性状。国内外研究人员利用QTL定位和候选基因法对影响乳头数的数量性状基因座(Quantitative trait loci，QTL)进行了研究，但是结果并不理想。近年来，随着猪全基因组序列的公布和高密度SNP(single nucleotidepolymorphism，单核苷酸多态)芯片的开发，使得全基因组关联分析(Genomic-wideassociation study，GWAS)在鉴别影响复杂性状的分子标记和候选基因方面显示出强大的检测能力，并已广泛用到猪重要经济性状的遗传解析中。因此，采用GWAS分析策略可以鉴别到与猪总乳头数相关的分子标记，效应大的SNP可以运用到分子标记辅助选择和基因组选择中，从而加快猪总乳头数性状的遗传改良进展提高经济效益。

发明内容

为了克服现有技术的不足和缺点，本发明的首要目的在于提供一种位于猪7号染色体上与总乳头数相关的SNP分子标记。

本发明的另一目的在于提供上述位于猪7号染色体上与总乳头数相关的SNP分子标记的应用。

本发明的再一目的在于提供一种鉴定上述SNP分子标记的引物对。

本发明的第四个目的在于提供上述引物对的应用。

本发明的第五个目的在于提供一种猪的遗传改良方法。

本发明的目的通过下述技术方案实现：

一种位于猪7号染色体上与总乳头数相关的SNP分子标记，其SNP位点对应于国际猪基因组11.1版本参考序列7号染色体上第97568284位GA突变；

所述的位于猪7号染色体上与总乳头数相关的SNP分子标记的核苷酸序列如SEQID NO：1所示，其中序列中的M是A或G，导致猪总乳头数的不同；

所述的位于猪7号染色体上与总乳头数相关的SNP分子标记的SNP位点为SEQIDNO:1序列标注位置为131位的A131-G131的核苷酸突变；

所述的位于猪7号染色体上与总乳头数相关的SNP分子标记在鉴定猪总乳头数性状和猪遗传育种中的应用；