[发明专利]位于猪16号染色体上与猪瘦肉率和眼肌面积相关的SNP分子标记及应用

说明书

本发明属于分子生物技术和分子标记技术领域，具体涉及一种位于猪16号染色体上与猪瘦肉率和眼肌面积相关的SNP分子标记及应用。所述的位于猪16号染色体上与猪瘦肉率和眼肌面积相关的SNP分子标记的SNP位点对应于国际猪参考基因组11.1版本16号染色体上第33757844bp处的AC突变；该分子标记是通过全基因组关联分析得到，可显著影响猪100kg体重时眼肌面积和瘦肉率的性状。本发明还提供了一种用于鉴定该分子标记的引物对，利用该分子标记和引物对可建立高效准确的分子标记辅助育种技术，将其应用于猪眼肌面积和瘦肉率性状遗传改良中，从而增加猪眼肌面积和提高猪瘦肉率，提高企业利润，增加核心竞争力。

技术领域

本发明属于分子生物技术和分子标记技术领域，具体涉及一种位于猪16号染色体上与猪瘦肉率和眼肌面积相关的SNP分子标记及应用。

背景技术

目前，全球育种目标已经从脂肪型猪向瘦肉型猪转变，提高瘦肉率是猪的主要育种目标。眼肌面积是衡量瘦肉率的一个重要指标之一，且这两个性状呈有利的正相关关系，因此育种工作者也通过增加猪的眼肌面积来提高瘦肉率。几十年来，人们通过传统的选育方法来增加眼肌面积和提高瘦肉率，使得这两个性状得到一定程度上的改良。但眼肌面积和瘦肉率是复杂的数量性状，受多基因调控。因此，通过传统的选育方法来改良这两个性状，耗时长且收效甚微。如若能利用分子标记辅助选择(marker assisted selection，MAS)技术同时改良猪的眼肌面积和瘦肉率，将进一步加快这两个性状的育种进程，能够显著提高生猪养殖的经济效益。

杜长大(杜洛克猪×长白猪×大白猪)是全球最受欢迎的商业猪品种，杜洛克猪被广泛用作杜长大商品猪的终端父本。杜洛克作为终端父本直接影响杜长大的生产性能，而商品猪的生产性能直接影响到养殖场的经济效益。因此，对核心群杜洛克猪的眼肌面积和瘦肉率性状进行改良，能够较大程度的将改良得到的优势遗传给商品猪后代，增强商品猪的生产竞争力，从而提高养殖场的经济效益。

发明内容

为了克服现有技术的不足和缺点，本发明的首要目的在于提供一种位于猪16号染色体上与猪瘦肉率和眼肌面积相关的SNP分子标记。

本发明的另一目的在于提供上述位于猪16号染色体上与猪瘦肉率和眼肌面积相关的SNP分子标记的应用。

本发明的再一目的在于提供一种鉴定上述位于猪16号染色体上与猪瘦肉率和眼肌面积相关的SNP分子标记的引物对。

本发明的第四个目的在于提供上述引物对的应用。

本发明的第五个目的在于提供一种猪的遗传改良方法。

本发明的目的通过下述技术方案实现：

一种位于猪16号染色体上与猪瘦肉率和眼肌面积相关的SNP分子标记，其SNP位点对应于国际猪参考基因组11.1版本16号染色体上第33757844bp处的AC突变；

所述的位于猪16号染色体上与猪瘦肉率和眼肌面积相关的SNP分子标记的核苷酸序列为SEQ ID NO.1所示，其中序列中的M是A或C，导致猪眼肌面积和瘦肉率性状的不同；

所述的位于猪16号染色体上与猪瘦肉率和眼肌面积相关的SNP分子标记的SNP位点为SEQ IDNO:1序列标注位置为26位的A26-C26的核苷酸突变(位于该序列片段第26核酸单碱基突变，命名为：g.26AC)；

所述的位于猪16号染色体上与猪瘦肉率和眼肌面积相关的SNP分子标记在鉴定杜洛克猪眼肌面积和瘦肉率性状和遗传育种中应用；

一种检测猪眼肌面积和瘦肉率性状的方法，包含如下步骤：

检测猪16号染色体上上述位于猪16号染色体上与猪瘦肉率和眼肌面积相关的SNP分子标记，所述的SNP分子标记的5’端第33757844位单核苷酸是A还是C；