[发明专利]基因表达解析方法、基因表达解析用设备及基因表达解析装置

权利要求书

1.一种基因表达解析方法，其对包含组织或多个细胞的样品中的各个细胞中的生物体分子分别进行解析，该方法包括：

将所述样品载置在支撑体上的工序；

在所述支撑体中，核酸探针在支撑体表面或表面附近2维地分布并被固定，使所述样品的作为靶的被检核酸与该核酸探针杂交的工序，所述核酸探针包含被检核酸捕捉用序列和具有已知序列且根据在支撑体表面或表面附近的位置的不同而不同的细胞识别用标签序列；

进行与上述被检核酸互补的DNA链的合成，制作由包含上述标签序列的DNA互补链构成的cDNA文库的工序；以及

对上述cDNA文库的全部或一部分进行核酸扩增的工序。

2.根据权利要求1所述的方法，其中，核酸探针还包含分子识别用标签序列。

3.根据权利要求1所述的方法，其中，作为靶的被检核酸为构成生物体组织的细胞内的mRNA，使细胞识别用标签序列包含在比该细胞的尺寸小的每个区域不同的序列，由此能够以保存有构成生物体组织的细胞在平面内的位置信息的形态制作cDNA文库。

4.根据权利要求3所述的方法，其中，生物体组织为组织切片，将构成该组织切片的细胞内的mRNA向支撑体转录，所述支撑体上固定有包含在每个区域不同的细胞识别用标签序列的核酸探针。

5.根据权利要求1所述的方法，其中，作为靶的被检核酸为排列成2维保持的阵列状的多个细胞内的mRNA，使细胞识别用标签序列包含对每一个细胞不同的序列，由此能够以保存有该多个细胞的位置信息的形态制作cDNA文库。

6.根据权利要求1所述的方法，其中，核酸探针还包含转录因子的启动子序列，核酸扩增工序包含使用该转录因子由cDNA转录为cRNA的转录反应。

7.根据权利要求1所述的方法，其中，还包含对扩增出的产物进行测序的工序。

8.一种基因表达解析用设备，其用于对包含组织或多个细胞的样品中的各个细胞中的生物体分子分别进行解析，该设备具有用于载置所述样品的支撑体，所述支撑体中，在所述支撑体表面或表面附近2维地分布并固定有核酸探针，所述核酸探针包含：被检核酸捕捉用序列、具有已知序列且根据在支撑体表面或表面附近的位置的不同而不同的细胞识别用标签序列、和具有已知序列的通用引物序列。

9.根据权利要求8所述的基因表达解析用设备，其中，核酸探针还包含分子识别用标签序列。

10.根据权利要求8所述的基因表达解析用设备，其中，被检核酸捕捉用序列包含与作为靶的被检核酸的一部分互补的序列。

11.根据权利要求8所述的基因表达解析用设备，其中，支撑体由对波长300nm～10000nm的光中的至少一部分波长的光为透明的材料制作。

12.根据权利要求8所述的基因表达解析用设备，其中，支撑体为细孔片。

13.一种基因表达解析装置，其用于对包含组织或多个细胞的样品中的各个细胞中的生物体分子分别进行解析，具有：

基因表达解析用设备，该设备具有用于载置所述样品的支撑体，所述支撑体中，在所述支撑体表面或表面附近2维地分布并固定有核酸探针，所述核酸探针包含：被检核酸捕捉用序列、具有已知序列且根据在支撑体表面或表面附近的位置的不同而不同的细胞识别用标签序列、和具有已知序列的通用引物序列；

用于将试剂引入上述基因表达解析用设备的单元，所述试剂用于合成与作为靶的被检核酸互补的DNA链；

用于将用于进行核酸扩增的试剂引入上述基因表达解析用设备的单元；和

用于控制上述基因表达解析用设备的温度的单元。

14.根据权利要求13所述的基因表达解析装置，还具有：

显微镜；以及

使显微镜像和使用上述设备获得的上述被检核酸的定量数据对应的单元，所述显微镜像是在从细胞提取上述作为靶的被检核酸前由上述显微镜观察到的。