[发明专利]一种个体化叶酸补充剂量的基因检测方法

说明书

本发明提供了一种用于个体化叶酸补充剂量的基因检测方法，通过设计用于扩增rs1801133、rs1801131、rs1805087以及rs1801394位点的引物，对个体中与叶酸代谢紧密相关的4个SNP位点进行扩增，进一步分析个体扩增片段的基因型，根据个体基因型的差异给出叶酸需求量的建议。本方法操作简便，应用性强，适合推广使用。

技术领域

本发明涉及基因检测领域，特别涉及一种与叶酸吸收、代谢、后期反应相关基因的基因型别数据库，叶酸相关基因的基因分型方法，以及判断叶酸缺乏及过量的检测方法。

背景技术

B族维生素，全是水溶性维生素，在体内滞留的时间只有数小时，必须每天补充。虽然《中国居民膳食指南2016》(以下简称“指南”)给出了每种B族维生素相对于中国人群的推荐补充剂量，但是每个人对于B族维生素的实际需求是不同的，简单地按照《指南》推荐的剂量补充并不是个体的最优化方案。

造成B族维生素需求个体差异的因素有许多，包括性别、年龄、体重等多个方面，其中最主要的是遗传因素，包括B族维生素的代谢、转运以及作用相关基因的遗传多态性。研究表明，特定的基因位点多态性会影响维生素的吸收、代谢及转化效率，使B族维生素在不同个体中的需求会偏离《指南》中的推荐量。其中，与维生素B1需求量相关的基因为SLC35F3，相应SNP位点为rs17514104；与维生素B2需求量相关的基因为MTHFR，相应SNP位点为rs1801133和rs1801131；与维生素B3需求量相关的基因为LPL、SIRT1和HERC4，相应SNP位点分别为rs285、rs1467568和rs497849；与叶酸(维生素B9)需求量相关的基因为MTHFR、MTR和MTRR，相应SNP位点为rs1801133、rs1801131、rs1805087和rs1801394；与维生素B12需求量相关的基因为CLYBL、FUT6、MS4A3和FUT2，相应SNP位点分别为rs41281112、rs3760776、rs2298585和rs602662。其详细的对应关系和原理如下：

SLC35F3编码硫胺素转运蛋白，rs17514104位于SLC35F3基因内部，其变异位点与SLC35F3的硫胺素(维生素B1)转运活性显著相关。

与维生素B2相关的基因为MTHFR，其编码产物亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)是一个依赖维生素B2作为辅因子的还原酶。SNP位点rs1801133和rs1801131位于MTHFR基因内部，导致MTHFR基因型不同；进而导致其与维生素B2的亲和力不同，进一步活性差异很大，最终导致对体内同型半胱氨酸的清除效率高低不同。对这些异常人群，适当补充维生素B2可提高MTHFR的催化活性，消除基因型导致的酶活降低，同时降低相关疾病如神经管畸形等发生的风险。

与维生素B3相关的基因有三个，分别为LPL、SIRT1和HERC4。LPL编码脂蛋白脂肪酶，是血脂代谢过程的关键酶，能够调节血液中甘油三酯的含量。rs285(C变T)是LPL基因上风险位点，导致LPL活性降低。联合相关分析表明，该携带风险位点(TT)的人群维生素B3摄入不足时，患代谢综合征的概率升高。SIRT1基因产物与DNA抗氧化相关，其位点rs1467568G位点携带者易患糖尿病，每天服用19.8mg VB3降低该风险至正常。HERC4基因毗邻SIRT1基因，与其共享rs497849位点。