[发明专利]一种同时检测5个磺胺类耐药基因的多重液相基因芯片引物、试剂盒及其分析方法在审

专利信息
申请号: 201910245722.6 申请日: 2019-03-28
公开(公告)号: CN109762917A 公开(公告)日: 2019-05-17
发明(设计)人: 徐凤姣;闵凡贵;王静;黄韧 申请(专利权)人: 广东省实验动物监测所
主分类号: C12Q1/689 分类号: C12Q1/689;C12Q1/6837;C12Q1/04;C12N15/11
代理公司: 广州市科丰知识产权代理事务所(普通合伙) 44467 代理人: 王海曼
地址: 510000 广东省广州*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 引物 耐药基因 磺胺类 试剂盒 基因芯片 检测 细菌耐药性检测 核苷酸序列 检测引物 分析 灵敏度 准确率 样本
【说明书】:

发明公开了一种同时检测5个磺胺类耐药基因的多重液相基因芯片引物、试剂盒及其分析方法,旨在提供一种操作简单,能够同时检测磺胺类耐药基因int1,sul1,sul2,sul3和sul4而且具有灵敏度高,准确率高,可实现同一样本中的多种不同目的分子同时进行检测引物、试剂盒及其分析方法;其技术方案包括引物核苷酸序列如SEQ ID NO:1‑SEQ ID NO:10所示的引物;本发明属于细菌耐药性检测领域。

技术领域

本发明属于实验动物的病原检测领域,具体涉及一种同时检测磺胺类耐药基因int1,sul1,sul2,sul3和sul4的多重液相基因芯片分析方法及试剂盒。

背景技术

沙门氏菌、大肠杆菌等革兰氏阴性菌是重要的致病菌,由于抗生素大规模不合理的使用,使得这些致病菌出现了严重的多重耐药性,导致大部分现有药物无效。由质粒介导的耐药基因可传递给其他动物和人类,在给养殖业造成了严重经济损失的同时,也影响着食品安全和人类健康。

Ⅰ类整合子(int1)作为可移动的DNA片段,能够捕获外源耐药基因并将耐药基因水平传播,对细菌的耐药性传播有非常重要的意义。致病菌对磺胺类广泛耐药与磺胺类耐药相关基因sul1、sul2、sul3和sul4基因有关。sul1基因常与其他耐药基因整合到Ⅰ类整合子上,sul2基因常位于非接合性质粒或可移动多重耐药质粒上,sul3和sul4是新近发现的磺胺类耐药相关基因。传统的表型检测采用药敏试验方法及自动化药敏检测方法,该方法以细菌培养为基础,能直观反应病原菌对某种药物敏感或耐药,但药敏结果报告较慢,经验依赖性强,操作繁琐,不能完全适应临床治疗的需要。

现有的磺胺类耐药基因检测主要靠普通单重PCR和多重PCR。已报道的针对大肠杆菌和沙门氏菌的多重PCR(int1、sul1、sul2、sul3)检测耐药基因,产物片段大小从/285bp到898bp不等,没有对多重PCR的灵敏度做探讨,存在较高的漏检风险。而且,无论是单重还是多重PCR技术,其结果判定都需要凝胶电泳,费时费力,在实际应用中遇到样品量大的情况,很难满足检测需求。

另外,随着磺胺类耐药基因sul4的发现,目前国内还未见到一种能同时检测5种磺胺类耐药基因的检测方法,也未见有应用多重免疫荧光分析方法检测磺胺类耐药基因的报道。

发明内容

本发明的目的在于提供一种灵敏度高,准确性好,同时检测磺胺类耐药基因int1,sul1,sul2,sul3和sul4的多重液相基因芯片分析引物对。

为此,本发明提供的第一个技术方案为:

一种同时检测5个磺胺类耐药基因的多重液相基因芯片引物,所述的5个磺胺类耐药基因分别为:int1,sul1,sul2,sul3和sul4;其中:

int1检测引物对:P1核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,P2核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示;

sul1检测引物对:P3核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示,P4核苷酸序列如SEQ ID NO:4所示;

sul2检测引物对:P5核苷酸序列如SEQ ID NO:5所示,P核苷酸序列如SEQ ID NO:6所示;

sul3检测引物对:P7核苷酸序列如SEQ ID NO:7所示;P8核苷酸序列如SEQ ID NO:8所示;

sul4检测引物对:P9核苷酸序列如SEQ ID NO:9所示;P10核苷酸序列如SEQ IDNO:10所示。

优选的,上述的同时检测5个磺胺类耐药基因的多重液相基因芯片引物,

所述引物P1和P2其中一条引物的5’端被生物素化;

所述引物P3和P4其中一条引物的5’端被生物素化;

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