[发明专利]一种解析花生属种间遗传关系有效简易的方法有效

专利信息
申请号: 201910063038.6 申请日: 2019-01-23
公开(公告)号: CN109554445B 公开(公告)日: 2021-09-21
发明(设计)人: 王娟;单世华;闫彩霞;赵晓波;李春娟;苑翠玲;孙全喜 申请(专利权)人: 山东省花生研究所(山东省农业科学院花生工程技术研究中心)
主分类号: C12Q1/6858 分类号: C12Q1/6858
代理公司: 北京中北知识产权代理有限公司 11253 代理人: 王皎
地址: 266000 山东*** 国省代码: 山东;37
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摘要:
搜索关键词: 一种 解析 花生 属种间 遗传 关系 有效 简易 方法
【权利要求书】:

1.一种解析花生属种间遗传关系有效简易的方法,其特征在于:利用花生属多个物种叶绿体基因组筛选得到一个高突变区,可通过简单扩增和测序来快速有效地解析花生属种间遗传关系;包括如下步骤:

(1)根据已有数据库记录获取栽培种花生及其近缘物种叶绿体全基因组基因序列;

(2)将多个物种叶绿体全基因组基因序列进行核苷酸多态性分析,锚定叶绿体全基因组范围内的高突变区域并进行注释;

(3)对选定高突变区域进行引物设计,PCR扩增和一代测序后,构建系统发生树来快速有效地解析花生属种间遗传关系;所述高突变区域为psbE-petL基因间隔区,扩增所述psbE-petL基因间隔区的上游引物和下游引物的核苷酸序列为:

上游引物:5’-GGGCATTCTAAGGTAACTCGTT-3’;

下游引物:5’-AAGCACTTCCCTAAGTTTCCAA-3’。

2.根据权利要求1所述的一种解析花生属种间遗传关系有效简易的方法,其特征在于:所述步骤(3)中,随机选取几个具有叶绿体全基因组的花生属的物种,通过DNA提取的方法将每个物种随机选取2-3粒完整种子,培养皿中浸种3-4d,待种子萌发出芽后置入培养盒,28℃下培养10-13d,使用植物基因组DNA提取试剂盒提取花生叶片DNA。

3.根据权利要求1所述的一种解析花生属种间遗传关系有效简易的方法,其特征在于:所述步骤(3)中,PCR扩增的反应体系为Master Mix 12.5μL、DNA模板0.5μL、ddH2O10μL、上游引物1μL、下游引物1μL。

4.根据权利要求1所述的一种解析花生属种间遗传关系有效简易的方法,其特征在于:所述步骤(3)中,PCR扩增的反条件为95℃预变性5min,94℃变性50s,58℃退火1min,72℃延伸50s,33个循环,72℃再延伸7min,通过一代测序方法,获得扩增片段序列。

5.根据权利要求1所述的一种解析花生属种间遗传关系有效简易的方法,其特征在于:所述步骤(3)中,利用MEGA软件对多个扩增序列片段构建系统关系树。

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