[发明专利]单分子肽测序的手段和方法在审
申请号: | 201880063048.3 | 申请日: | 2018-09-28 |
公开(公告)号: | CN111148831A | 公开(公告)日: | 2020-05-12 |
发明(设计)人: | N·卡勒维尔特;S·艾克曼;S·德沃斯 | 申请(专利权)人: | 非营利性组织佛兰芒综合大学生物技术研究所;国立比利时根特大学 |
主分类号: | C12N9/64 | 分类号: | C12N9/64 |
代理公司: | 北京市中咨律师事务所 11247 | 代理人: | 陈迎春;黄革生 |
地址: | 比利*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 分子 肽测序 手段 方法 | ||
1.一种作用于多肽的工程化的、催化活性氨肽酶,其中所述多肽通过其C-末端或通过所述多肽的第一个肽键的C-末端肽部分固定于表面上,其中所述氨肽酶裂解所述多肽的N-末端氨基酸,和其中所述氨肽酶直至所述N-末端氨基酸裂解的停留时间鉴定或分类所述N-末端氨基酸。
2.权利要求1的氨肽酶,其中所述N-末端氨基酸是衍生的N-末端氨基酸,并且其中所述氨肽酶结合并裂解所述衍生的N-末端氨基酸。
3.权利要求2的氨肽酶,其中所述N-末端氨基酸是用异硫氰酸酯或异硫氰酸酯类似物衍生的N-末端氨基酸。
4.权利要求1-3任一项的氨肽酶,其中所述N-末端氨基酸是用CITC或SPITC衍生的,并且所述氨肽酶与SEQ ID No.1或SEQ ID No.2具有至少80%序列同一性并且具有25位的甘氨酸残基,65位的丝氨酸残基,138位的半胱氨酸残基和208位的组氨酸残基。
5.权利要求4的氨肽酶,包含SEQ ID No.3或SEQ ID No.4中所示的氨基酸序列。
6.权利要求1的氨肽酶,其中所述氨肽酶与SEQ ID No.7具有至少80%序列同一性,其中在1位的甲硫氨酸残基和2位的丙氨酸残基之间插入半胱氨酸残基。
7.权利要求6的氨肽酶,其包含SEQ ID No.8或由SEQ ID No.8组成。
8.权利要求1-7任一项的氨肽酶,其进一步包含光学、电学或等离子体标记,或其中通过光学、电学或等离子体来检测所述氨肽酶。
9.权利要求1-8任一项的氨肽酶,其中所述氨肽酶是嗜热和/或耐溶剂的。
10.裂解诱导剂获得多肽的序列信息的用途,所述多肽通过其C-末端或通过所述多肽的第一个肽键的C-末端肽部分固定于表面上,其中所述裂解诱导剂在所述多肽的N-末端氨基酸上的停留时间鉴定或分类所述N-末端氨基酸。
11.根据权利要求10的用途,其中所述裂解诱导剂是催化活性的氨肽酶、异硫氰酸酯或异硫氰酸酯类似物。
12.根据权利要求11的用途,其中所述催化活性的氨肽酶是权利要求1或6-9任一项的氨肽酶,和其中N-末端氨基酸选自Leu、Met、Tyr、Arg、Pro、Gly、Lys、Ala和Val。
13.根据权利要求11的用途,其中所述催化活性的氨肽酶是权利要求2的氨肽酶,和其中所述衍生的末端氨基酸是衍生的N-末端氨基酸。
14.根据权利要求13的用途,其中所述衍生的N-末端氨基酸是用CITC或SPITC衍生的,和其中所述氨肽酶是权利要求4、5、8或9任一项的氨肽酶。
15.权利要求10-14任一项的用途,其中在单分子水平获得所述多肽的所述序列信息。
16.一种鉴定或分类多肽的N-末端氨基酸的方法,所述多肽通过其C-末端或通过所述多肽的第一个肽键的C-末端肽部分固定于表面上,所述方法包括:
a)将所述表面固定的多肽接触裂解诱导剂,其中所述裂解诱导剂结合并裂解所述多肽的N-末端氨基酸;
b)测量所述裂解诱导剂在所述N-末端氨基酸上的停留时间;
c)将所述测量的停留时间与所述裂解诱导剂和一组N-末端氨基酸特征性的一组参照停留时间值进行比较;
以鉴定或分类所述N-末端氨基酸。
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