[发明专利]检测人类免疫缺陷病毒(HIV)的测定法

权利要求书

1.用于扩增和检测样品中的一个或多个人类免疫缺陷病毒-1(HIV-1)核酸序列的寡核苷酸序列的组，其包括：

(a)扩增和检测HIV-1整合酶(INT)基因的至少一部分的引物和探针组，其包括包含SEQID NO:1的正向引物寡核苷酸序列、包含SEQ ID NO:2的反向引物寡核苷酸序列和探针寡核苷酸序列，和

(b)扩增和检测HIV-1长末端重复(LTR)区域的至少一部分的引物和探针组，其包括包含SEQ ID NO:5的正向引物寡核苷酸序列、包含SEQ ID NO:6的反向引物寡核苷酸序列、第一探针寡核苷酸序列和第二探针寡核苷酸序列，

其中每个探针寡核苷酸序列包含可检测的标记和/或猝灭剂部分。

2.根据权利要求1所述的组，其中扩增和检测HIV-1INT基因的至少一部分的引物和探针组的探针寡核苷酸是双链的，并且包括包含可检测的标记的第一核酸序列和包含猝灭剂部分的第二核酸序列。

3.根据权利要求2所述的组，其中第一核酸序列包括SEQ ID NO:3并且第二核酸序列包括SEQ ID NO:4。

4.根据权利要求1-3中任一项所述的组，其中扩增和检测HIV-1LTR区域的一部分的引物和探针组的第一和第二探针寡核苷酸序列中的每一个是双链的，并且包括包含可检测的标记的第一核酸序列和包含猝灭剂部分的第二核酸序列。

5.根据权利要求4所述的组，其中第一探针寡核苷酸序列包括SEQ ID NO:7和SEQ IDNO:8的核酸序列，并且第二探针寡核苷酸序列包括SEQ ID NO:9和SEQ ID NO:10的核酸序列。

6.根据权利要求1-5中任一项所述的组，其进一步包括：

(c)包含SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:53或SEQ ID NO:54的内对照正向引物寡核苷酸序列，

(d)包含SEQ ID NO:12的内对照反向引物寡核苷酸序列，和

(e)包含SEQ ID NO:13和可检测的标记的内对照探针寡核苷酸序列。

7.根据权利要求1-6中任一项所述的方法，其中可检测的标记是荧光团。

8.用于检测怀疑含有人免疫缺陷病毒-1(HIV-1)的样品中的HIV-1的方法，所述方法包括：

(a)使从人获得的样品与根据权利要求1-7中任一项所述的寡核苷酸序列的组和用于扩增和检测核酸序列的试剂接触，

(b)扩增样品中存在的HIV-1INT基因的至少一部分和/或HIV-1LTR区域的至少一部分，

(c)将检测HIV-1INT基因的一部分的探针寡核苷酸与HIV-1INT基因的扩增的部分杂交，和/或将检测HIV-1LTR区域的一部分的第一探针寡核苷酸序列和第二探针寡核苷酸序列与HIV-1LTR区域的扩增的部分杂交，

(d)通过评价来自可检测的标记中的每一种的信号来检测探针寡核苷酸序列与HIV-1INT基因和/或LTR区域的部分的杂交，由此

(i)来自检测HIV-1INT基因的至少一部分的探针寡核苷酸序列上可检测的标记的信号的存在表明探针寡核苷酸序列与HIV-1INT基因的一部分的杂交以及样品中HIV-1的存在；和/或

(ii)来自第一探针寡核苷酸序列和/或第二探针寡核苷酸序列的信号的存在表明第一探针寡核苷酸序列和/或第二探针寡核苷酸序列与LTR区域的一部分的杂交以及样品中HIV-1的存在，和

(iii)信号的不存在表明样品中HIV-1的不存在。

9.根据权利要求8所述的方法，其中样品包括血液、血清、血浆、唾液、尿液、阴道液或精液。