[发明专利]包含核酸可编程DNA结合蛋白的核碱基编辑器在审

专利信息
申请号: 201880033446.0 申请日: 2018-03-23
公开(公告)号: CN110914426A 公开(公告)日: 2020-03-24
发明(设计)人: D.R.刘;A.C.科摩;L.陈;H.A.里斯 申请(专利权)人: 哈佛大学的校长及成员们
主分类号: C12N15/11 分类号: C12N15/11;C12N15/10
代理公司: 北京市柳沈律师事务所 11105 代理人: 余晓文
地址: 美国马*** 国省代码: 暂无信息
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摘要:
搜索关键词: 包含 核酸 可编程 dna 结合 蛋白 碱基 编辑器
【权利要求书】:

1.融合蛋白,其包含:(i)核酸可编程DNA结合蛋白(napDNAbp);(ii)胞苷脱氨酶域;和(iii)尿嘧啶糖基化酶抑制剂(UGI)域,其中所述napDNAbp是CasX、CasY、Cpf1、C2c1、C2c2、C2c3或Argonaute蛋白。

2.权利要求1的融合蛋白,其中所述融合蛋白包含2、3、4或5个UGI域。

3.权利要求1或2的融合蛋白,其中所述核酸可编程DNA结合蛋白(napDNAbp)是CasX蛋白。

4.权利要求3的融合蛋白,其中所述CasX蛋白包含

(i)与SEQ ID NO:29或30至少90%相同的氨基酸序列;或

(ii)SEQ ID NO:29或30的氨基酸序列。

5.权利要求1或2的融合蛋白,其中所述核酸可编程DNA结合蛋白(napDNAbp)是CasY蛋白。

6.权利要求5的融合蛋白,其中所述CasY蛋白包含与SEQ ID NO:31至少90%相同的氨基酸序列。

7.权利要求5或6的融合蛋白,其中所述CasY蛋白包含SEQ ID NO:31的氨基酸序列。

8.权利要求1或2的融合蛋白,其中所述核酸可编程DNA结合蛋白(napDNAbp)是Cpf1或Cpf1突变体蛋白。

9.权利要求8的融合蛋白,其中所述Cpf1或Cpf1突变体蛋白包含与SEQ ID NO:9-16中的任一项至少90%相同的氨基酸序列。

10.权利要求8或9的融合蛋白,其中所述Cpf1或Cpf1突变体蛋白包含SEQ ID NO:9-16中任一项的氨基酸序列。

11.权利要求1或2的融合蛋白,其中所述核酸可编程DNA结合蛋白(napDNAbp)是C2cl蛋白。

12.权利要求11的融合蛋白,其中所述C2cl蛋白包含与SEQ ID NO:26至少90%相同的氨基酸序列。

13.权利要求11或12的融合蛋白,其中所述C2cl蛋白包含SEQ ID NO:26的氨基酸序列。

14.权利要求1或2的融合蛋白,其中所述核酸可编程DNA结合蛋白(napDNAbp)是C2c2蛋白。

15.权利要求14的融合蛋白,其中所述C2c2蛋白包含与SEQ ID NO:27至少90%相同的氨基酸序列。

16.权利要求14或15的融合蛋白,其中所述C2c2蛋白包含SEQ ID NO:27的氨基酸序列。

17.权利要求1或2的融合蛋白,其中所述核酸可编程DNA结合蛋白(napDNAbp)是C2c3蛋白。

18.权利要求17的融合蛋白,其中所述C2c3蛋白包含与SEQ ID NO:28至少90%相同的氨基酸序列。

19.权利要求17或18的融合蛋白,其中所述C2c3蛋白包含SEQ ID NO:28的氨基酸序列。

20.权利要求1或2的融合蛋白,其中所述核酸可编程DNA结合蛋白(napDNAbp)是Argonaute蛋白。

21.权利要求20的融合蛋白,其中所述Argonaute蛋白包含与SEQ ID NO:25至少90%相同的氨基酸序列。

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