[发明专利]用于评估发展乳腺癌的风险的改进方法

说明书

本公开涉及用于评估人类女性受试者发展乳腺癌的风险的方法和系统。具体而言，本公开涉及将简化的临床风险评估与遗传风险评估相结合以改进风险分析。

技术领域

本公开涉及用于评估人类女性受试者发展乳腺癌的风险的方法和系统。具体而言，本公开涉及将简化的临床风险评估与遗传风险评估相结合以改进风险分析。

发明背景

据估计，在美国，约八分之一的妇女将在其生存期发展乳腺癌。预计2013年有超过23万名妇女诊断为患有浸润性乳腺癌，近4万名将死于该疾病(ACS Breast Cancer Facts&Figures 2013-14)。因此，有迫切的理由预测哪些妇女会发展疾病，并采取措施来预防。

广泛的研究集中在表型风险因素，包括年龄、家族史、生殖史和良性乳腺疾病。将这些风险因素的各种组合编辑成两种最常用的风险预测算法；Gail模型(适合一般群体)(也称为乳腺癌风险评估工具：BCRAT)和Tyrer-Cuzick模型(适合具有较强家族史的妇女)。

这些风险预测算法很大程度上依赖于通常通过问卷获得的自我报告的临床信息。在一些情况下，没有提供相关的临床信息。这是意料之中的，因为一些问题依赖于几十年前的记忆(第一次月经)，而其他问题则需要患者的医疗水平和/或实际病理学报告(非典型增生)。此外，对于那些输入答案而不是‘未知’的人来说，这就对输入算法中的数据的准确性提出了质疑。例如，非典型增生是否存在是乳腺癌风险评估的一个重要因素(相对风险>4.0)。

最近，用于评估发展乳腺癌风险的市售测试讨论了通过将临床风险评分与遗传风险评分结合来预测乳腺癌风险。然而，这些测试的临床风险评估组分受到了自我报告临床信息的上述限制。因此，本领域需要经过改进的乳腺癌风险评估测试。

发明内容

本发明人已经鉴定出简化的临床风险评估，该简化的临床风险评估可与遗传风险评估相结合以提供评估女性受试者乳腺癌风险的改进方法。

在一个实施方案中，本公开涉及用于评估人类女性受试者发展乳腺癌风险的方法，该方法包括：

对所述女性受试者进行临床风险评估，其中所述临床风险评估仅基于女性受试者年龄、乳腺癌家族史及族群中的两个或全部；

对所述女性受试者进行遗传风险评估，其中所述遗传风险评估涉及检测来自女性受试者的生物样品中已知与乳腺癌相关的至少两个单核苷酸多态性的存在；及

将所述临床风险评估与所述遗传风险评估相结合，以获得人类女性受试者发展乳腺癌的风险。

例如，所述遗传风险评估可包括检测已知与乳腺癌相关的至少3、5、10、20、30、40、50、60、70、80个单核苷酸多态性的存在。

在一个实施方案中，在没有协变量的对数加性模型下，通过逻辑回归单独测试单核苷酸多态性与乳腺癌的相关性。

在另一实施方案中，所述单核苷酸多态性选自由以下组成的组：rs2981582、rs3803662、rs889312、rs13387042、rs13281615、rs4415084、rs3817198、rs4973768、rs6504950及rs11249433或与其中一个或多个连锁不平衡的单核苷酸多态性。在另一实施方案中，所述单核苷酸多态性选自表6或与其中一个或多个连锁不平衡的单核苷酸多态性。

在另一实施方案中，所述遗传风险评估可包括检测与乳腺癌相关的至少72个单核苷酸多态性，其中至少67个单核苷酸多态性选自表7或与其中一个或多个连锁不平衡的单核苷酸多态性，且其余单核苷酸多态性选自表6或与其中一个或多个连锁不平衡的单核苷酸多态性。