[发明专利]一种检测ACVR1基因SNP位点基因分型PCR引物和方法在审
申请号: | 201811646890.8 | 申请日: | 2018-12-30 |
公开(公告)号: | CN109609637A | 公开(公告)日: | 2019-04-12 |
发明(设计)人: | 李新建;叶建伟;李秀领;王克君;韩雪蕾;乔瑞敏;吕刚 | 申请(专利权)人: | 河南农业大学 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/6883;C12N15/11 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 450000 河*** | 国省代码: | 河南;41 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基因分型 基因型 酶切 种检测 引物 基因 分子检测技术 扩增反应体系 电泳图谱 反应程序 基因序列 肌肉组织 酶切产物 酶切位点 引物稀释 条带 切割 合成 检测 引入 预测 | ||
本发明涉及分子检测技术领域,且公开了一种检测ACVR1基因SNP位点基因分型PCR引物和方法,步骤一:PCR引物设计与合成,根据NCBI上预测的猪ACVR1基因序列,在NCBI中设计用于PCR的引物,引物稀释后终浓度为(10pmol/L);步骤二:PCR扩增,以步骤一中提取的肌肉组织DNA为模板,利用引物进行PCR扩增,PCR扩增的反应程序;步骤三:扩增反应体系。该检测ACVR1基因SNP位点基因分型PCR引物和方法,通过在PCR产物中引入了内对照酶切位点,克服了所用快酶NdeI切割PCR产物的效率相对较低,容易造成酶切不完全的弊端,可根据酶切产物的电泳图谱识别酶切不完全的情形,并且在酶切不完全的情况下,仍可根据各基因型的特征条带的状况来判别基因型,确保了基因型判别的准确性。
技术领域
本发明涉及分子检测技术领域,具体为一种检测ACVR1基因SNP位点基因分型PCR引物和方法。
背景技术
ACVR1基因是胚胎发育和生长必不可少的,涉及了多细胞和组织类型,如肌肉、骨骼和神经系统等,并且在小鼠发育过程具有时空表达特异性。研究表明敲除ACVR1基因使得小鼠胚胎在发育早期就出现阻滞现象,因此研究ACVR1基因在组织/器官发育中的功能时多采用条件突变(conditional mutants)。目前对ACVR1基因的研究主要集中在进行性肌肉骨化症(Fibrodysplasia Ossificans Progressiva,FOP)以及神经胶质瘤(DiffuseIntrinsic Pontine Glioma,DIPG)等疾病的研究上,并揭示了与两者相关的关键突变。
目前,检测ACVR1基因rs324003968的基因型的方法有PCR-RFLP法、测序法、荧光PCR、基因芯片等。除了PCR-RFLP法外,其他方法均需昂贵设备或试剂、素质要求高的人员、繁琐的操作、高的检测成本。PCR-RFLP法操作简单,对仪器设备要求低,便于应用。因此,本发明提出了一种检测ACVR1基因SNP位点基因分型PCR引物和方法。
发明内容
(一)解决的技术问题
针对现有技术的不足,本发明提供了一种检测ACVR1基因SNP位点基因分型PCR引物和方法具备通过在PCR产物中引入了内对照酶切位点,克服了所用快酶NdeI切割PCR产物的效率相对较低,容易造成酶切不完全的弊端,可根据酶切产物的电泳图谱识别酶切不完全的情形,并且在酶切不完全的情况下,仍可根据各基因型的特征条带的状况来判别基因型,确保了基因型判别的准确性的优点,解决了目前ACVR1基因SNP位点基因分型的方法要求素质要求高的人员、繁琐的操作、高的检测成本的问题。
(二)技术方案
为实现上述的目的,本发明提供如下技术方案:一种检测ACVR1基因SNP位点基因分型PCR引物,具体如下:
ACVR1基因PCR引物序列信息:
>15dna:chromosome chromosome:Sscrofa10.2:15:72093370:72093970:1
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