[发明专利]一种关于水稻柱头外露主效QTL位点的分子标记方法

权利要求书

1.一种关于水稻柱头外露主效QTL位点的分子标记方法，包括以下水稻实验材料：高柱头外露品种DS与低柱头外露品种C9083，两个亲本进行杂交，后代构建群体进行检测实验。

2.水稻柱头外露主效QTL位点qPES-3b的分子标记方法，其特征在于如下步骤：

(1)取水稻高柱头外露品种DS与低柱头外露品种C9083的杂交后代的叶片，提取基因组DNA；

(2)利用GS09或RM15206中的任意一个或两个分子标记对所述的杂交后代基因组DNA进行PCR扩增，PCR扩增产物在8％非变性聚丙烯酰胺凝胶上进行电泳检测。如果扩增出与高柱头外露亲本DS一致的DNA片段，标志着增效等位变异基因的存在。其中，所述的GS09分子标记引物序列为，GS09F：GCAACCAAGTCCACGCTAAT，GS09R：TAGCCGAAGATCAGCCTCCT；RM15206分子标记引物序列为，RM15206F：CATTTCTTTGCCCTCGATCTTTCC，RM15206R：AAGCGCCATAATCCAGGAACC。

3.根据权利要求1所述的水稻柱头外露主效QTL位点qPES-3b的分子标记方法，其特征在于所述的PCR反应：体积为10μl，其中10×PCR Buffer(25mmol/LMg2⁺)1μl，引物对(2μM)1μl，dNTP(10mM)0.2μl，Taq酶(5U/μl)0.25μl，模板(10-100ng/μl)1.5μl，加水至10μl。PCR反应程序为94℃预变性2min；94℃变性30s，55℃退火30s，72℃延伸展30s，循环35次；最后72℃延伸10min。扩增产物在8％非变性聚丙烯酰胺凝胶上进行电泳分离。