[发明专利]一种快速鉴定感染日本血吸虫钉螺的方法有效
申请号: | 201811342007.6 | 申请日: | 2018-11-12 |
公开(公告)号: | CN111172244B | 公开(公告)日: | 2023-08-08 |
发明(设计)人: | 杨坤;赵松;李婷;李伟;张键锋;刘燕红;羊海涛;郭利川;王智宏;应清界 | 申请(专利权)人: | 江苏省血吸虫病防治研究所;江苏奇天基因生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6844 | 分类号: | C12Q1/6844 |
代理公司: | 苏州国卓知识产权代理有限公司 32331 | 代理人: | 陆晓鹰 |
地址: | 214064 江苏*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 快速 鉴定 感染 日本 血吸虫 钉螺 方法 | ||
1.一种快速鉴定感染日本血吸虫钉螺的方法,其特征在于:
包括快速无毒无害无需清洗纯化的阳性钉螺DNA提取方法和RAA快速检测阳性钉螺DNA方法;
所述快速无毒无害无需清洗纯化的阳性钉螺DNA提取方法的步骤如下:
1)、将钉螺研磨碎后挑去壳置于离心管中,加入溢过钉螺软体足量清洗液A,震荡混匀,12000rpm离心2min,倒去上清;
所述清洗液A的组分为NaCl和Na3C6H5O7;
其中NaCl的质量百分浓度为0.1-1.5%;Na3C6H5O7的质量百分浓度为1-2.5%。
2)、用研磨棒将钉螺组织进行充分研磨;
3)、向上述离心管中加入500μL裂解液B,震荡混匀,80℃水浴锅中静置5-10min;
所述裂解液B的组分为NaOH、Triton X-100、SDS、PH为8.0的EDTA;其中NaOH的体积摩尔浓度为0.1-1mol/L,Triton X-100的质量百分浓度为0.2-2%,SDS的质量百分浓度为0.1-0.4%,EDTA的体积摩尔浓度为0.1-0.5mmol/L;
4)、将经过水浴后的离心管置于离心机中,12000rpm离心5min,取400μL上清于一新的离心管中,加入160μL Buffer C,震荡混匀,12000rpm离心5min,将上清转移至一新的离心管中,-20℃保存备用,完成DNA提取,所述Buffer C组成为CH3COOH,CH3COOH的体积摩尔浓度为1-2mol/L;
RAA快速检测阳性钉螺DNA方法,包括特异性引物和荧光探针;
特异性正向引物序列:
5’-TCATCTCTGATCTGTATGCCTTTCCATTAG-3’,
特异性反向引物序列:
5’-AGTTAACTAAAAGTCAGTCAGTCACTTACAACG-3’;
所述荧光探针序列为:
5’-TACTCTGTTACTACCTCCTCTACTCTGGGATCTGGTCCGAAAATTT-3’
所述荧光探针分别标记有一个报告荧光基团和一个淬灭荧光基团,所述报告荧光基团为FAM荧光基团;所述的猝灭荧光基团为BHQ;经过荧光基团修饰后的探针为:
5’-TACTCTGTTACTACCTCCTCTACTCTGGGA/i6FAMdT//THF//iBHQdTGGTCCGAAAATTT-3’;
等温扩增的温度为35~42℃;
等温扩增的时间为5~20min;
扩增体系的体积为25~100μL;
血吸虫样本DNA加样量的体积为1~5μL;
使用正向引物浓度0.02~0.1mM,反向引物浓度0.02~0.1mM;
探针的浓度为0.02~0.07mM。
2.根据权利要求1所述的一种快速鉴定感染日本血吸虫钉螺的方法,其特征在于:所述清洗液A中NaCl的质量百分浓度为0.9%,Na3C6H5O7的质量百分浓度为1.5%。
3.根据权利要求1所述的一种快速鉴定感染日本血吸虫钉螺的方法,其特征在于:所述裂解液B中NaOH的体积摩尔浓度为0.3mol/L,Triton X-100的质量百分浓度为1%,SDS的质量百分浓度为0.2%,EDTA的体积摩尔浓度为0.1mmol/L。
4.根据权利要求1所述的一种快速鉴定感染日本血吸虫钉螺的方法,其特征在于:所述Buffer C中CH3COOH的体积摩尔浓度为1.2mol/L。
5.根据权利要求1所述的一种快速鉴定感染日本血吸虫钉螺的方法,其特征在于:所述等温扩增的温度为39℃;所述等温扩增的时间为20min;
所述扩增体系的体积为50μL;
所述血吸虫样本DNA加样量的体积为2μL;
正向反向引物浓度为0.05mM,加入正向反向引物体积各2μL;
探针的浓度为0.03mM;使用体积为0.5μL。
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