[发明专利]一种基于RPA技术用于检测河蟹布尼亚病毒的引物及检测方法在审
| 申请号: | 201811301320.5 | 申请日: | 2018-11-02 |
| 公开(公告)号: | CN109295259A | 公开(公告)日: | 2019-02-01 |
| 发明(设计)人: | 沈怀舜;臧亚南;胡亚成 | 申请(专利权)人: | 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心 |
| 主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6844;C12R1/93 |
| 代理公司: | 苏州国诚专利代理有限公司 32293 | 代理人: | 李思睿 |
| 地址: | 214000 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 病毒 检测 引物 分子检测技术 引物特异性 待测样本 辅助检测 检测结果 扩增产物 水产动物 特异性强 现场诊断 有效检测 灵敏度 | ||
1.一种基于RPA技术用于检测河蟹布尼亚病毒的引物,其特征在于:所述引物包括上游引物RPA ESBV-1F和下游引物RPA ESBV-1R,所述上游引物RPA ESBV-1F的核苷酸序列如SEQID NO.1所示,所述下游引物RPA ESBV-1R的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。
2.一种根据权利要求1所述引物在检测或辅助检测河蟹布尼亚病毒中的应用。
3.一种基于RPA技术检测或辅助检测河蟹布尼亚病毒的RPA试剂盒,其特征在于:所述RPA试剂盒包括权利要求1所述的引物。
4.一种基于RPA技术检测或辅助检测河蟹布尼亚病毒的方法,具体包括以下步骤:
(1)cDNA制备:从待测河蟹肝胰脏或其他河蟹组织中提取病毒RNA,然后反转录成cDNA备用;
(2)RPA扩增及琼脂糖凝胶电泳:以步骤(1)中制备的cDNA作为模板,用权利要求3所述的RPA试剂盒进行RPA扩增,用琼脂糖凝胶电泳检测RPA扩增产物大小;
(3)结果判定:若所述RPA扩增产物含有大小为160bp的片段,则所述待测河蟹中含有了布尼亚病毒,若所述RPA扩增产物不含有大小为160bp的片段,则所述待测河蟹中不含有布尼亚病毒。
5.根据权利要求4所述的一种基于RPA技术检测或辅助检测河蟹布尼亚病毒的方法,其特征在于:
所述步骤(2)RPA扩增及琼脂糖凝胶电泳的具体步骤如下所示:
(1)配制47.5μl的混合反应液,包括29.5μl Rehydration Buffer,10μM的上游引物2.4μl,10μM的下游引物2.4μl,模板cDNA 1μl和dH2O 12.5μl;
(2)混合液混匀后转移至含有冻干酶粉的反应单元管中,用移液枪混匀,使管中颗粒全部悬浮,加入280mM醋酸镁溶液2.5μl,盖上管盖,快速混匀,在39℃金属浴反应4min,4min结束后,取出,剧烈翻转8-10次,混匀,重新放入金属浴上反应40min;RPA反应结束后,向RPA扩增产物中加入50μL苯酚/氯仿(1∶1)溶液,充分混匀后,11,000×g离心3min,取上清液10μL于1.0%琼脂糖凝胶电泳,琼脂糖凝胶电泳检测电压180V,电流250A,检测时间20min,在凝胶成像系统上观察结果。
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