[发明专利]一种基于细长反应腔的RNA转录组分析方法在审

专利信息
申请号: 201811207205.1 申请日: 2018-10-17
公开(公告)号: CN109439733A 公开(公告)日: 2019-03-08
发明(设计)人: 涂景;黄梦婷;刘文丽;陆祖宏;孙蓓丽 申请(专利权)人: 东南大学
主分类号: C12Q1/6844 分类号: C12Q1/6844
代理公司: 南京苏高专利商标事务所(普通合伙) 32204 代理人: 郑立发
地址: 211102 *** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 反应腔 微观反应 反转录 扩增反应体系 操作复杂度 发生装置 反应腔体 反应系统 复杂反应 扩增反应 微量液体 物质交换 系统调试 相对独立 分析 微液滴 细长型 细长形 分隔 扩增 微腔 制备 捕获 精密 放大
【权利要求书】:

1.一种基于细长反应腔的RNA转录组分析方法,其特征在于,包括将RNA反转录扩增反应体系注入细长型的反应腔中,完成对目标RNA转录组的捕获和放大。

2.根据权利要求1所述的基于细长反应腔的RNA转录组分析方法,其特征在于,所述RNA为总RNA、信使RNA、核糖体RNA、微小RNA、长链非编码RNA和环状RNA中的一种或多种。

3.根据权利要求1所述的基于细长反应腔的RNA转录组分析方法,其特征在于,所述RNA反转录扩增,是采用反转录酶和核酸聚合酶,对目标RNA核酸片段进行反转录和核酸扩增,转变为DNA并提高其绝对质量。

4.根据权利要求1所述的基于细长反应腔的RNA转录组分析方法,其特征在于,所述核酸扩增,为采用核酸聚合酶和随机序列引物的等温扩增,或者为采用核酸聚合酶和特异序列引物进行的聚合酶链式扩增。

5.根据权利要求4所述的基于细长反应腔的RNA转录组分析方法,其特征在于,所述随机序列引物,其长度为5至40个碱基,其中包含一个或多个简并碱基,该随机序列引物为普通未修饰引物,或者为经过硫代修饰、硫酸化修饰或氨基修饰的修饰引物。

6.根据权利要求1所述的基于细长反应腔的RNA转录组分析方法,其特征在于,所述细长型的反应腔,反应腔中反应溶液所处的区域,区域总长度和反应腔内部平均横截面积的平方根之间的比值在5:1到2×106:1之间。

7.根据权利要求1所述的基于细长反应腔的RNA转录组分析方法,其特征在于,所述细长型的反应腔,反应腔中反应溶液所处的区域,反应腔内部的平均横截面积在25平方微米到4平方毫米之间。

8.根据权利要求1所述的基于细长反应腔的RNA转录组分析方法,其特征在于,所述细长型的反应腔,反应腔的横截面为圆形、椭圆形、正方形或长方形,反应腔各部分的横截面相同或者不相同。

9.根据权利要求1所述的基于细长反应腔的RNA转录组分析方法,其特征在于,所述细长型的反应腔,反应腔为塑料、玻璃或金属材质的微细管道,或者是通过微加工工艺在微流控芯片中制备的细长形流道。

10.根据权利要求1所述的基于细长反应腔的RNA转录组分析方法,其特征在于,所述目标RNA转录组,为一种或多种人类、动物、植物或微生物的RNA转录组。

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