[发明专利]一种数字PCR引物及其定量检测副干酪乳杆菌含量的用途在审
申请号: | 201810885845.1 | 申请日: | 2018-08-06 |
公开(公告)号: | CN109517912A | 公开(公告)日: | 2019-03-26 |
发明(设计)人: | 周巍;张岩;李永波;张雅伦;杨岚;张薇;张翠侠;王赞;陈晨;刘帅;刘昊 | 申请(专利权)人: | 河北省食品检验研究院(国家果类及农副加工产品质量监督检验中心;河北省食品安全实验室);河北农业大学 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/686;C12Q1/06;C12N15/11;C12R1/245 |
代理公司: | 石家庄轻拓知识产权代理事务所(普通合伙) 13128 | 代理人: | 王璐 |
地址: | 050091 河北省石家*** | 国省代码: | 河北;13 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 定量检测 副干酪乳杆菌 数字PCR 引物 致病菌 方法体系 过程控制 技术保障 技术应用 生产企业 细菌去除 污染菌 构建 微滴 检测 开发 | ||
1.一种数字PCR引物,其特征在于:所述PCR引物包含:上游引物如SEQ ID NO:1所示、下游引物如SEQ ID NO:2所示。
2.包含权利要求1所述数字PCR引物的检测试剂盒。
3.权利要求1所述数字PCR引物用于定量检测副干酪乳杆菌含量的用途。
4.根据权利要求3所述的用途,其特征在于:采用微滴式数字PCR方法定量检测副干酪乳杆菌的含量。
5.根据权利要求4所述的用途,其特征在于:所述微滴式数字PCR方法包含如下步骤:
A、DNA的提取:取待测样品并提取其中的DNA,保存备用;
B、引物设计:引物对于检测结果的准度、精度、专一度起决定作用,直接采用权利要求1记载的引物;
C、ddPCR反应体系的建立:2-50μL 2×混合液,引物稀释到5-50μmol/L,上游引物和下游引物各加入0.5-5.0μL,将模板DNA加入2-10μL,用ddH2O补至10-50μL;
D、ddPCR检测方法的建立:将充分混匀的PCR反应体系转移到微滴发生卡中,并向微滴发生卡中加入10-100μL Droplet Genera-tion Oil,将微滴发生卡放到微滴发生器中进行反应;随后将生成的微滴转移到ddPCR的96孔中,用封膜仪对96孔板封膜,准备进行PCR反应;ddPCR的反应程序:95℃预变性,10min;94℃变性,1min;56℃退火,45s;进行40个循环,98℃10min;
E、检测结果的获取:ddPCR反应结束后将96孔板放入QX200 Droplet Reader,依次录入样品信息,检测开始后仪器会按顺序自动识别每个样品的微滴,在微滴读取油的配合下微滴依次通过双色检测器,根据微滴发出的荧光信号的强度判定阳性和阴性结果,并记录下每个样品的阳性和阴性的微滴数;信号采集完毕后,软件Quantasoft将计算出最终结果并以图像的形式给出。
6.根据权利要求5所述的用途,其特征在于:步骤A中,DNA提取的具体操作方法为:取0.5μL浓度为10mg/mL的PMA溶液加入到1mL菌悬液中,PMA终浓度为5μg/mL,充分混匀后,室温避光5min;用500W卤素灯曝光5min,且光源距离心管的垂直距离为20cm;曝光期间离心管置于冰上并持续摇晃离心管,避免局部过热和保证反应充分;曝光结束后12000r/min离心5min,弃上清,无菌水洗涤2次后重悬备用;使用细菌基因组DNA提取试剂盒对上述菌体DNA进行提取后-20℃保存备用。
7.根据权利要求5所述的用途,其特征在于:步骤C中,所述模板DNA用量为4μL;上游引物和下游引物的用量为1.2μL,引物稀释到10μmol/L。
8.根据权利要求5所述的用途,其特征在于:步骤C中,所述2×混合液为2×EvagreenqPCR Master Mix,用量为10μL;所述ddH2O补齐至20μL。
9.根据权利要求5所述的用途,其特征在于:步骤D中,所述Droplet Genera-tion Oil的用量为70μL。
10.根据权利要求5所述的用途,其特征在于:检测完成后,利用微滴检测仪验证ddPCR对副干酪乳杆菌检测的特异性和灵敏度进行验证。
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