[发明专利]用于检测rs1057910的引物探针组及其应用

说明书

本发明公开了一种用于检测rs1057910的引物探针组及其应用。本发明首先保护一种引物探针组，由引物F、引物R和探针P组成；引物F为序列表的序列1所示的单链DNA分子；引物R为序列表的序列2所示的单链DNA分子；探针P为一个末端具有荧光基团且另一个末端具有荧光淬灭基团的单链DNA分子，且DNA分子中的部分核苷酸为锁核酸，DNA分子的核苷酸序列为序列表的序列3所示。本发明可用于检测rs1057910，判断待测样本基于该位点的基因型，从而指导用药，具有重大的应用推广价值。

技术领域

本发明涉及一种用于检测rs1057910的引物探针组及其应用。

背景技术

细胞色素P450（Cytochrome P450或CYP450，简称CYP450）代表着一个很大的可自身氧化的亚铁血红素蛋白家族，属于单氧酶的一类，因其在450纳米有特异吸收峰而得名。它参与内源性物质和包括药物、环境化合物在内的外源性物质的代谢。根据氨基酸序列的同源程度，其成员又依次分为家族、亚家族和酶个体三级。细胞色素P450酶系统可缩写为CYP，其中家族以阿拉伯数字表示，亚家族以大写英文字母表示，酶个体以阿拉伯数字表示，如CYP2D6、CYP2C19、CYP3A4等。人类肝细胞色素P450酶系中至少有9种P450与药物代谢相关。

肝脏是人体重要的解毒器官，许多药物都经肝脏代谢，细胞色素P450是主要的肝细胞Ⅰ相代谢酶之一，有多个亚家族，其中CYP2C9是第二亚家族中的一个重要成员，占肝微粒体P450蛋白总量的20%。CYP2C9蛋白由490个氨基酸残基组成，分子量53kDa，是一种膜结合的血红蛋白。CYP2C9基因位于染色体区10q24.2上，全长约为55kb，由9个外显子构成。近几年来，很多CYP2C9的多态性位点被不断发现，表明CYP2C9具有高度的遗传多态性。迄今为止，至少有32种CYP2C9编码区突变被发现并被人类细胞色素P450等位基因命名法委员会记载。CYP2C9的基因频率在不同人种和不同民族之间差异很大。其最主要的单核苷酸多态性有3种，即野生型CYP2C9*1、突变体CYP2C9*2和突变体CYP2C9*3。CYP2C9*3突变型等位基因为1075位碱基由A突变为C。

CYP2C9能代谢许多不同性质的药物。据统计，目前约有16%的临床药物由CYP2C9负责代谢。由CYP2C9酶代谢的药物主要包括：①抗惊厥药：苯妥因；②抗凝血：华法林、醋酸香豆素、苯丙香豆素；③抗糖尿：甲苯磺丁脲、格列苯脲、格列美脲、格列吡嗪；④非甾体抗炎药：西乐葆、双氯芬酸、布洛芬、甲芬那酸、吡罗昔康、替诺昔康、氯诺昔康；⑥抗高血压：氯沙坦、厄贝沙坦；⑦利尿药：托拉塞米。

在中国人口中，除了野生型CYP2C9*1，已发现的最主要的基因型是CYP2C9*3，其基因频率约为3.3%，低于在高加索人中的频率，而其它基因型之前都极少被检出。携带CYP2C9*3基因多态型的人群氧化代谢药物的能力大大降低,导致体内血浆药物浓度显著升高。在这些药物当中，一些具有比较窄的治疗指数的药物的代谢受到更多关注，如华法林、甲苯磺丁脲和苯妥因，因为CYP2C9代谢活性的减损可能影响药物的体内实际剂量，还可能造成中毒。

发明内容

本发明的目的是提供一种用于检测rs1057910的引物探针组及其应用。

本发明首先保护一种引物探针组，由引物F、引物R和探针P组成；

引物F为如下（a1）或（a2）：

（a1）序列表的序列1所示的单链DNA分子；

（a2）将序列1经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列1具有相同功能的DNA分子；

引物R为如下（b1）或（b2）：

（b1）序列表的序列2所示的单链DNA分子；

（b2）将序列2经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列2具有相同功能的DNA分子；