[发明专利]一种耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)核酸恒温扩增方法在审
| 申请号: | 201810803884.2 | 申请日: | 2018-07-20 |
| 公开(公告)号: | CN110734988A | 公开(公告)日: | 2020-01-31 |
| 发明(设计)人: | 商学军;居金良;于明辉;崔振玲 | 申请(专利权)人: | 上海仁度生物科技有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/6844;C12Q1/14;C12N15/11 |
| 代理公司: | 31266 上海一平知识产权代理有限公司 | 代理人: | 徐迅;崔佳佳 |
| 地址: | 201201 上海市浦东新区张江*** | 国省代码: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 扩增 耐甲氧西林金黄色葡萄球菌 特异性引物 特征性序列 待测样品 高灵敏度 恒温扩增 甲氧西林 检测样品 扩增产物 准确度 低污染 金黄色 拷贝数 核酸 球菌 引物 检测 应用 | ||
1.一种耐甲氧西林金黄色葡萄球菌MRSA的扩增方法,其特征在于,所述扩增方法包括步骤:在反应体系中进行扩增,所述的反应体系中含有针对MRSA的SA 23s rRNA和mecA RNA的特异性引物对,所述引物对包括:
(i)SA 23s rRNA的T7引物:序列如SEQ ID NO:4所示;
(ii)SA 23s rRNA的nT7引物:序列如SEQ ID NO:5所示;
(iii)mecA RNA的T7引物:序列如SEQ ID NO:6所示;和
(iv)mecA RNA的nT7引物:序列如SEQ ID NO:7所示。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述反应体系还包括:耐甲氧西林金黄色葡萄球菌MRSA SA 23s rRNA和mecA RNA的捕获探针。
3.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述反应体系还包括:耐甲氧西林金黄色葡萄球菌MRSA SA 23s rRNA的特异性检测探针和mecA RNA的特异性检测探针。
4.如权利要求3所述的方法,其特征在于,所述方法还包括步骤:在扩增反应过程之中或之后,检测耐甲氧西林金黄色葡萄球菌MRSA SA 23s rRNA和mecA RNA的特异性检测探针发出的荧光信号。
5.一种耐甲氧西林金黄色葡萄球菌MRSA的非诊断性检测方法,其特征在于,所述检测方法包括:
(a)提供一反应体系,所述反应体系含有待测样品,并且所述反应体系还含有耐甲氧西林金黄色葡萄球菌MRSA SA 23s rRNA的特异性检测探针和mecA RNA的特异性检测探针;
(b)用如权利要求1中所述的扩增方法对所述反应体系进行扩增;和
(c)在扩增反应过程之中或之后,检测耐甲氧西林金黄色葡萄球菌MRSA SA 23s rRNA的特异性检测探针和mecA RNA的特异性检测探针发出的荧光信号。
6.一种耐甲氧西林金黄色葡萄球菌MRSA的检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括:
(a)第一容器,以及位于所述容器内的用于扩增耐甲氧西林金黄色葡萄球菌MRSA的SA23s rRNA的特异性引物对,所述引物对包括:
(i)SA 23s rRNA的T7引物:序列如SEQ ID NO:4所示;
(ii)SA 23s rRNA的nT7引物:序列如SEQ ID NO:5所示;
(b)第二容器,以及位于所述容器内的用于扩增耐甲氧西林金黄色葡萄球菌MRSA的mecA RNA的特异性引物对,所述引物对包括:
(iii)mecA RNA的T7引物:序列如SEQ ID NO:6所示;和
(iv)mecA RNA的nT7引物:序列如SEQ ID NO:7所示;
以及(c)使用说明书。
7.如权利要求6所述的试剂盒,其特征在于,还含有选自下组的一种或多种组分:
(d)捕获探针;
(e)检测探针;
(f)MRSA内标序列;和/或
(g)内标检测探针。
8.如权利要求7所述的试剂盒,其特征在于,包括选自下组的一个或多个特征:
所述MRSA SA 23s rRNA检测探针包括如SEQ ID NO:8所示的核苷酸序列,且mecA RNA检测探针包括如SEQ ID NO:9所示的核苷酸序列;和/或
所述的捕获探针包括如SEQ ID NO:3所示的核苷酸序列;和/或
所述MRSA SA 23s rRNA内标序列包括如SEQ ID NO:12所示的核苷酸序列,而所述MRSASA 23s rRNA的内标检测探针包括如SEQ ID NO:14所示的核苷酸序列;和/或
所述mecA RNA内标序列包括如SEQ ID NO:13所示的核苷酸序列;而mecA RNA的内标检测探针包括如SEQ ID NO:15所示的核苷酸序列。
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