[发明专利]一种用于鉴别脓肿分枝杆菌和马赛分枝杆菌的引物探针组合在审
申请号: | 201810756530.7 | 申请日: | 2018-07-11 |
公开(公告)号: | CN108866216A | 公开(公告)日: | 2018-11-23 |
发明(设计)人: | 逄宇;王玉峰;黄海荣;杜建;李亮;许绍发;张洪静;田建 | 申请(专利权)人: | 首都医科大学附属北京胸科医院;北京市结核病胸部肿瘤研究所 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/04;C12Q1/686;C12N15/11;C12R1/32 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 关畅;秦梦楠 |
地址: | 101149*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 脓肿分枝杆菌 分枝杆菌 引物探针 鉴别 分子技术 分子水平 快速鉴定 单链DNA 复合群 灵敏性 组合本 | ||
1.引物探针组合,由引物F1、引物R1、探针P1和探针P2组成;
所述引物F1为如下(a1)或(a2):
(a1)序列表的序列1所示的单链DNA分子;
(a2)将序列1经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列1具有相同功能的DNA分子;
所述引物R1为如下(a3)或(a4):
(a3)序列表的序列2所示的单链DNA分子;
(a4)将序列2经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列2具有相同功能的DNA分子;
所述探针P1为如下(a5)或(a6):
(a5)序列表的序列3所示的单链DNA分子;
(a6)将序列3经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列3具有相同功能的DNA分子;
所述探针P2为如下(a7)或(a8):
(a7)序列表的序列4所示的单链DNA分子;
(a8)将序列4经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列4具有相同功能的DNA分子。
2.如权利要求1所述的引物探针组合,其特征在于:
所述探针P1由荧光基团甲和淬灭基团修饰;
所述探针P2由荧光基团乙和淬灭基团修饰;
荧光基团甲和荧光基团乙为不同的荧光基团。
3.如权利要求2所述的引物探针组合,其特征在于:
荧光基团甲为FAM荧光基团;
荧光基团乙为HEX荧光基团。
4.权利要求1至3任一所述的引物探针组合的应用,为如下(b1)-(b4)中的任一种:
(b1)鉴别脓肿分枝杆菌和马赛分枝杆菌;
(b2)检测待测样本中是否含有脓肿分枝杆菌或马赛分枝杆菌;
(b3)制备用于鉴别脓肿分枝杆菌和马赛分枝杆菌的试剂盒;
(b4)制备用于检测待测样本中是否含有脓肿分枝杆菌或马赛分枝杆菌的试剂盒。
5.含有权利要求1至3任一所述的引物探针组合的试剂盒;所述试剂盒的用途为如下(c1)或(c2):
(c1)鉴别脓肿分枝杆菌和马赛分枝杆菌;
(c2)检测待测样本中是否含有脓肿分枝杆菌或马赛分枝杆菌。
6.权利要求5所述试剂盒的制备方法,包括将各条引物探针单独包装的步骤。
7.含有权利要求1至3任一所述的引物探针组合或权利要求5所述的试剂盒的系统;所述系统的用途为如下(c1)或(c2):
(c1)鉴别脓肿分枝杆菌和马赛分枝杆菌;
(c2)检测待测样本中是否含有脓肿分枝杆菌或马赛分枝杆菌。
8.如权利要求7所述的系统,其特征在于:所述系统还包括利用定量PCR鉴别脓肿分枝杆菌和马赛分枝杆菌所需要的仪器。
9.一种鉴别脓肿分枝杆菌和马赛分枝杆菌的方法,包括如下步骤:以待测菌株的基因组DNA为模板,采用权利要求2或3任一所述的引物探针组合进行荧光定量PCR,如果荧光基团甲通道显示阳性结果且荧光基团乙通道显示阳性结果,待测菌株为脓肿分枝杆菌,如果荧光基团甲通道显示阳性结果且荧光基团乙通道显示阴性结果,待测菌株为马赛分枝杆菌。
10.一种检测待测样本中是否含有脓肿分枝杆菌或马赛分枝杆菌的方法,包括如下步骤:以待测样本的总DNA为模板,采用权利要求2或3任一所述的引物探针组合进行荧光定量PCR,如果荧光基团甲通道显示阳性结果且荧光基团乙通道显示阳性结果,待测样本中中含有脓肿分枝杆菌;如果荧光基团甲通道显示阳性结果且荧光基团乙通道显示阴性结果,待测样本中中含有马赛分枝杆菌;如果荧光基团甲通道显示阴性结果且荧光基团乙通道显示阴性结果,待测样本中不含有马赛分枝杆菌且不含有脓肿分枝杆菌。
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