[发明专利]一种检测人乳腺癌基因PCAT1多态性rs4473999的引物及试剂盒

说明书

本发明公开了一种检测人乳腺癌基因PCAT1多态性rs4473999的引物及试剂盒，属于生物医学技术领域，所述引物包括正向引物和反向引物，所述正向引物的核苷酸序列如SEQ:ID:NO:2所示；所述反向引物的核苷酸序列如SEQ:ID:NO:3所示，本发明的另外一个目的在于，提供一种检测人乳腺癌基因PCAT1多态性rs4473999的试剂盒。本发明的检测人乳腺癌基因PCAT1多态性rs4473999的引物及试剂盒可预测乳腺癌的预后效果，可用于临床的预后判断。本发明具有操作简单、成本低、适用范围广泛的特点，适合推广应用。

技术领域

本发明属于生物医学技术领域，涉及一种检测人乳腺癌基因PCAT1多态性rs4473999的引物及试剂盒。

背景技术

单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism，SNP)，主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。它是人类可遗传的变异中最常见的一种。占所有已知多态性的90％以上。SNP在人类基因组中广泛存在，平均每500～1000个碱基对中就有1个，估计其总数可达300万个甚至更多。CAPs(cleaved amplificationpolymorphism sequence-tagged sites)CAPs技术又称为PCR-RFLP，限制性片段长度多态性聚合酶链反应(PCR-RFLP)技术。PCR-RFLP的基本原理是用PCR扩增目的DNA，扩增产物再用特异性内切酶消化切割成不同大小片段，然后在凝胶电泳上分辨。不同等位基因的限制性酶切位点分布不同，产生不同长度的DNA片段条带。此项技术大大提高了目的DNA的含量和相对特异性，而且方法简便，分型时间短。这种方法与RFLP相比，不同的是以扩增替代了酶切，避免了RFLP繁琐的DNA酶切、转移、杂交等步骤。

前列腺癌相关转录本1(PCAT1，prostate cancer associated transcript 1)基因是一种新型的lncRNA转录本，最初在前列腺癌中通过转录组测序发现，因此得名。PCAT1是位于8q24.21上的一个长度为2kb的lncRNA基因座，是最常见的原癌LncRNA之一。PCAT1是一种新型的前列腺癌ncRNA，它可以通过PRC2进行抑制，也可以通过对目标基因的转录调节来促进细胞增殖。此外，PCAT1位于8q24基因沙漠的位置，在经过充分研究的前列腺癌风险和c-MYC致癌基因的附近，这表明该基因位点及其在癌症中的频繁放大可能与癌症生物学的其他方面有关。已经有研究表明PCAT1基因多态性与多种肿瘤存在关联。Prensne等人对102例前列腺癌(PC)组织样本和RNA-seq的细胞系进行了全面的分析，通过PRC2和PCAT1遗传变异之间的相互作用表明这种ncRNA可能在前列腺癌的发展中扮演着重要的角色。JIFENG WEN等人和Deyuan Zhang等人的研究展示了一种新的分子机制，通过PCAT1遗传变异促进HCC的侵袭和转移，通过完全抑制mir-129-5p，从而逆转了HMGB1的表达。他们的研究为PCAT1遗传变异在HCC转移方面提供了新的见解，建议PCAT1遗传变异可以作为HCC诊断和治疗的潜在候选者。Weibo Xu等人的研究结果表明，PCAT1遗传变异通过上调miR-145-5p介导的FSCN1来加速PC细胞的增殖，迁移，侵袭和抑制细胞凋亡，这为PC患者提供了一种潜在的治疗策略。Ting-Hua Yan等人的研究表明在HCC组织中，lncRNA PCAT1的遗传变异受到了严格的控制，与生物的侵袭性和预后不良有关，并指出PCAT1的遗传变异是HCC患者的一个独立的预后影响因子。以上研究表明，PCAT1的遗传变异不仅与肿瘤患者的增殖有关，而且最新的研究发现与恶性肿瘤的转移和不良预后也存在关联。