[发明专利]一种影响猪日增重性状的SNP标记及其应用

说明书

本发明公开了一种影响猪日增重性状的分子标记及其应用，属于分子生物技术和分子标记技术领域。本发明所述的分子标记位点为SEQ ID NO：1所示，位于该序列片段第305核酸单碱基突变(命名为：g.305AT)。该SNP对应于国际猪参考基因组10.2版本6号染色体上第79026669个核苷酸位点AT突变。本发明还提供如上所述的SNP标记在杜洛克日增重性能遗传改良中的应用。本发明通过优选该SNP的优势等位基因，能够增加杜洛克日增重性状的遗传进展，减少杜洛克的日增重性状的育种时间，从而有效提高种猪育种的经济效益。

技术领域

本发明属于分子生物技术和分子标记辅助选择技术领域，特别涉及一种影响杜洛克种猪日增重性状的分子标记及其应用。

背景技术

随着猪肉消费量的提高，猪的生长性能越来越受到人们的关注。日增重作为衡量猪生长性能的重要指标，一直是种猪遗传改良研究中的重点。然而，日增重作为中等遗传力性状，传统的仅仅单纯的对表型进行选择的选育方法如人为的将日增重少的个体本身进行淘汰或者尽量不选择将其同胞和半同胞留种，实际收效甚微。目前，全基因组关联分析(Genome-wide Association Study,GWAS)已经逐步在复杂性状的遗传改良方面显示出独特的优势。如提高奶牛产奶量等。相对于候选基因法和QTL定位，GWAS可以更精准的定位和识别与性状高度关联的SNP位点，且不易受环境影响、性别、年龄影响，因此能进行早期选择，进而能起到缩短世代间隔、提高选选种效率的目的。因此如能利用GWAS技术改良种猪的日增重性状，将具备广阔的应用前景。

杜洛克猪作为优秀外来杂交配套系杜长大三元杂交猪的终端父本，由于其具有增重快，饲料报酬高，胴体品质好、眼肌面积大、瘦肉率高等优点而备受养殖生产者青睐。因此，对杜洛克猪的日增重性状进行改良，可以有效地缩短商品猪的育肥时间从而节约养殖成本。

此外，不少研究均表明，日增重与部分生长性状如瘦肉率、背膘厚之间有中等程度的表型相关和遗传相关，日增重的遗传规律改良对猪生长性能和生产效率的提高同样具有重要意义。

发明内容

本发明的首要目的在于提供一种影响猪日增重性状的分子标记，所述分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，其中序列中的M是T或A，导致猪日增重性状的不同。

所述分子标记的SNP位点对应于国际猪参考基因组10.2版本6号染色体上第79026669bp处的AT突变。

本发明的另一目的在于提供一种用于检测上述影响猪日增重性状的分子标记的引物对，所述引物对的核酸序列如下所示：

SEQ ID NO：2引物P001-F：5’-GGACTTGTGCCATCTAAA-3’；

SEQ ID NO：3引物P002-R：5’-TACCTGCTTCTGAGTAATGT-3’。

本发明的另一目的还在于提供一种用于检测上述分子标记的试剂盒，该试剂盒包括如上所述的SEQ ID NO：2和SEQ ID NO：3所示的引物对。

本发明的另一目的还在于提供上述的分子标记/引物对/试剂盒在鉴定影响猪日增重性状、或猪的日增重遗传育种中，或提高猪日增重中，或猪分子标记辅助育种中的应用。

本发明的另一目的在于提供上述的分子标记在筛选高日增重的猪品种的方法，具体为，检测猪6号染色体上SEQ ID NO：1所述的分子标记，所述分子标记的5’端第305位单核苷酸是A还是T，淘汰T保留A。

作为优选的实施方式，该方法采用上述的引物对或试剂盒进行检测。