[发明专利]杜鹃花枯萎病菌实时荧光PCR检测方法及其专用成套试剂有效

专利信息
申请号: 201810567517.7 申请日: 2018-06-05
公开(公告)号: CN108504768B 公开(公告)日: 2021-11-23
发明(设计)人: 段维军;郭立新;段丽君;张慧丽;李雪莲;陈先锋 申请(专利权)人: 宁波检验检疫科学技术研究院
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12Q1/686;C12Q1/04;C12N15/11
代理公司: 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 代理人: 关畅;魏少伟
地址: 315000 浙*** 国省代码: 浙江;33
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摘要:
搜索关键词: 杜鹃花 枯萎 病菌 实时 荧光 pcr 检测 方法 及其 专用 成套 试剂
【说明书】:

发明公开了杜鹃花枯萎病菌实时荧光PCR检测方法及其专用成套试剂。本发明公开的检测杜鹃花枯萎病菌的成套试剂,由名称为OV的引物对和名称为OV‑P的探针组成,OV由名称分别为OV‑F和OV‑R的单链DNA组成;OV‑F为序列表的序列1所示的单链DNA分子;OV‑R为序列表的序列2所示的单链DNA分子;OV‑P的核苷酸序列为序列表的序列3。实验证明,本发明的成套试剂检测杜鹃花枯萎病菌快速简单、特异性强、灵敏度高,且还可以实现定量检测,对于杜鹃花枯萎病菌的检测以及防控具有重大的应用推广价值。

技术领域

本发明涉及生物技术领域中,杜鹃花枯萎病菌实时荧光PCR检测方法及其专用成套试剂。

背景技术

杜鹃花枯萎病菌Ovulinia azaleae Weiss,隶属于真菌门(Fungi)、子囊菌亚门Ascomycota、子囊菌纲Ascomycetes、柔膜菌目Helotiales、核盘菌科Sclerotiniaceae、卵孢核盘菌属Ovulinia。

杜鹃花枯萎病菌已被列入我国进境植物检疫性有害生物名录,是一种检疫性植物病原真菌。目前,分布于美国、加拿大、阿根廷、德国、英国、比利时、法国、荷兰、日本、澳大利亚、新西兰。杜鹃花枯萎病菌主要为害花器,影响其观赏价值。

迄今为止,国内外检测杜鹃花枯萎病菌的方法局限于形态学检测方法,费时费力,需要15天以上,且容易漏检,出现假阴性结果,且对检测人员专业素质要求较高,难以满足快速、准确、灵敏鉴定的检测要求。

发明内容

本发明的目的是提供一种杜鹃花枯萎病菌实时荧光PCR检测方法及其专用成套试剂。

本发明首先提供了一种成套试剂,所述成套试剂由名称为OV的引物对和名称为OV-P的探针组成,所述OV由名称分别为OV-F和OV-R的单链DNA组成;

所述OV-F为如下(a1)或(a2):

(a1)序列表的序列1所示的单链DNA分子;

(a2)将序列1经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列1具有相同功能的DNA分子;

所述OV-R为如下(a3)或(a4):

(a3)序列表的序列2所示的单链DNA分子;

(a4)将序列2经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列2具有相同功能的DNA分子;

所述OV-P的核苷酸序列为如下(a5)或(a6):

(a5)序列表的序列3;

(a6)将序列3经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列3具有相同功能的序列。

所述OV-P的两端可分别带有荧光报告基团和荧光淬灭基团。具体的,所述OV-P的5'末端具有荧光报告基团FAM,3'末端具有荧光淬灭基团MGB。探针完整时,报告基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收,进行PCR扩增时,DNA聚合酶的5'-3'外切酶活性将探针酶切降解,使报告荧光基团和淬灭荧光基团分离,发出荧光信号,从而使荧光信号的累积与PCR产物形成完全同步。

所述成套试剂的用途可为如下(b1)、(b2)、(b3)或(b4):

(b1)鉴定杜鹃花枯萎病菌;

(b2)制备用于鉴定杜鹃花枯萎病菌的试剂盒;

(b3)检测待测样本是否含有杜鹃花枯萎病菌;

(b4)制备用于检测待测样本是否含有杜鹃花枯萎病菌的试剂盒。

上述成套试剂中,所述OV-F、所述OV-R、所述OV-P均可独立包装。所述OV-F、所述OV-R、所述OV-P的摩尔比可为1:1:1。

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