[发明专利]一种用于诊断RSV感染的环状RNA及其用途在审

专利信息
申请号: 201810554782.1 申请日: 2018-05-31
公开(公告)号: CN108754020A 公开(公告)日: 2018-11-06
发明(设计)人: 姚文霞;潘劲辉;周新科 申请(专利权)人: 广州医科大学附属第五医院
主分类号: C12Q1/70 分类号: C12Q1/70;C12Q1/686;C12N15/11;C12R1/93
代理公司: 广州三环专利商标代理有限公司 44202 代理人: 宋静娜;郝传鑫
地址: 510000 广*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 环状RNA 诊断 分子标志物 制备 分子指标 表达量 灵敏度 试剂盒 升高 筛选 细胞 检测 申请 发现
【说明书】:

发明公开了一种用于诊断RSV感染的分子标志物,所述分子标志物为来源于HERC5基因的环状RNA,其circBase ID为hsa_circ_0001426。本发明还公开了所述环状RNA在筛选或制备用于诊断RSV感染的试剂中的用途以及所述试剂在制备用于诊断RSV感染试剂盒中的用途。本申请发现,所述环状RNA在RSV感染细胞中的表达量显著升高,可以作为RSV感染检测的分子指标,具有简便、快捷、灵敏度和特异性高等优点。

技术领域

本发明属于生物检测技术领域,具体涉及一种用于诊断RSV感染的环状RNA及其用途。

背景技术

呼吸道合胞病毒(Respiratory Syncytial Virus,RSV)是引起婴幼儿、免疫力低下人群及老年人下呼吸道感染最主要病毒病原体之一,是导致婴幼儿住院的首要病因,全球每年约有16万例婴幼儿死于RSV相关的下呼吸道感染,医疗花费巨大。目前,除支持治疗以外,尚无特异性RSV疾病的治疗方案,也没有研制成功的预防该病毒感染的RSV疫苗可以有效减少疾病发生率。

随着高通量测序技术的飞速发展,数以万计的非编码转录产物不断被发现。研究表明,人类仅有1%~2%的基因组序列具备蛋白编码功能,而不具备蛋白质编码能力的非编码区竟高达98%以上,提示人体内有大量非编码RNA产生。环状RNA(circular RNA,circRNA)是一类以共价闭合环为特征,不含有5’端帽子和3’端poly A尾巴的非编码RNA分子。由于circRNA没有游离末端,使它们对RNA核酸外切酶存在一定的抵抗性。最新研究发现,circRNA作为非编码RNA的新成员,与多种疾病的发生发展密切相关,是一种充满前景的生物标记物和治疗靶点。

许多研究已证实,HERC5基因在抗病毒应答中发挥了重要作用,其抗病毒作用主要是通过ISG15及ISG化实现。HERC5可以连接泛素样蛋白分子ISG15与特异性蛋白底物;同泛素化过程相类似,ISG15共价结合到靶蛋白上,对靶蛋白进行修饰,这种结合称为ISG化,ISG15及ISG化在抗病毒反应中发挥重要作用。目前,对于人类抗病毒基因HERC5产生的环状RNA还未见报道,RSV病毒感染引起的环状RNA的表达变化亦未见报道。

发明内容

基于此,本发明的目的在于克服上述现有技术的不足之处而提供一种用于诊断RSV感染的试剂盒,能快速诊断RSV感染,具有简便、快捷、灵敏度和特异性高等优点。

为实现上述目的,本发明采用的技术方案为:一种用于诊断RSV感染的试剂盒,包含检测circBase ID为hsa_circ_0001426的环状RNA的表达量的试剂。

优选地,所述试剂包括扩增所述环状RNA的引物。

优选地,所述引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3所示。

优选地,所述试剂盒还包含RNA提取试剂、cDNA逆转录试剂和荧光染料。

人类HERC5基因可反向剪切产生多个环状RNA(已收录9个),其中包括本发明所述的circBase IDhsa_circ_0001426的环状RNA。所述环状RNA长度为1052bp的环状RNA,序列如SEQ ID NO.1所示。

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