[发明专利]一种与高邮鸭肌肉生长发育性状相关的SNP分子标记、其获取方法及应用

说明书

本发明公开了一种与高邮鸭肌肉生长发育性状相关的SNP分子标记、其获取方法和应用，所述分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示，其来自TNNI1基因，该序列的第130位为SNP突变位点，该位点的碱基为A或G。通过本发明的SNP分子标记所选育出来的高邮鸭的体重、胸腿肌重相关性状得到了提高，可以用于家系选育中的早期选择，也可在选配中提供分子依据。本发明的SNP分子标记为筛选高邮鸭体重、胸腿肌重提供了新的方法。

技术领域

本发明属于家禽基因工程的技术领域，更具体地，涉及一种与高邮鸭肌肉生长发育性状相关的SNP分子标记、其获取方法及应用。

背景技术

我国是世界上肉鸭生产和消费的第一大国。鸭肉脂肪含量低，不饱和脂肪酸含量多，鸭肉产品的需求在我国肉食产品需求总量中呈现刚性增长。但每年市场仍有7-8亿只缺口，与我国鸭业的发展速度、资源利用和发展规模相差甚远。目前，由北京鸭成功选育的国外引入品种樱桃谷鸭(70日龄平均体重约为3.3kg，胸肌率为17％，腿肌率为9％)在国内肉鸭市场占有绝对优势，近年来法国的南特鸭也进驻国内市场，而我国优良地方品种资源未能得到合理的挖掘利用，造成了国内优良地方品种资源的浪费。肉鸭育种中，选择性提高生长早期肉鸭骨骼肌的生长发育，是育种成功和产业升级的壁垒。随着现代生物技术和信息技术的发展，分子育种正在越来越多的被应用于改良畜禽品种，加快育种进展。

TNNI1基因属于肌钙蛋白I(Troponin I，TnI)的亚单位。TnI定位于横纹肌，主要功能是通过与Ca²⁺结合来调节肌球蛋白ATP酶的活性，进而调节肌肉的收缩。TnI基因包含三种亚型，根据组织分布和表达特异性，分为慢速骨骼肌型肌钙蛋白(TNNI1)、快速骨骼肌型肌钙蛋白I(TNNI2)和心肌型肌钙蛋白I(TNNI3)。TNNI1基因主要在人的成年期的慢收缩性骨骼肌中特异性表达。猪上的研究表明，TNNI1在猪胚胎期不同类型肌纤维都有表达，在快白肌纤维为主的肌肉中，表达高峰出现在120天，以慢肌纤维为主的肌肉中，表达高峰出现在60天；在羊上的研究表明，TNNI1基因在肌肉中的表达量随年龄的增加呈逐渐上升的趋势，半岁时表达量最低，2岁之后趋于平衡。在羊上的研究表明，TNNI1基因表达量与羊肌纤维的直径、横切面积等具有相关性。这些报道都有力地证明了TNNI1基因在动物的肌肉发育和生长发育中扮演着重要角色。课题组前期研究表明，TNNI1 mRNA表达量与鸭胸肌和腿肌肌纤维的直径和横切面积都无显著相关。TNNI1基因在鸟类可能存在不同于哺乳动物的功能与作用方式。

胚胎期是动物肌肉形成的重要时期，肌纤维细胞的数量基本固定下来，出生后数量不再增加。出生后产肉量的增加主要是肌纤维直径和长度的增加。胸肌和腿肌是鸭主要的产肉部位。目前，尚无TNNI1基因遗传变异与鸭肌肉生长发育性状的相关报道。高邮鸭是全国三大名鸭之一，生长发育快，肉质好，属于肉蛋兼用型地方品种。在育种工作中，与改变个体遗传特性(人工诱变)相比较，改变品种遗传结构还是比较容易的。而且在现有基因的基础上，通过改变基因频率来改进品种的遗传结构，其潜力还是很大的。

单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism，SNP)，主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。SNP作为第三代分子标记，具有数量多、分布广、代表性强和遗传稳定性好等特点。目前已经在动植物的遗传多样性分析、基因作图、分子标记辅助育种和功能基因学的研究中得到了广泛的应用。

因此，研究与高邮鸭肌肉生长发育性状相关的SNP分子标记，用于高邮鸭早期的选育，具有重要的意义。

发明内容

本发明的目的在于提供一种与高邮鸭肌肉生长发育性状相关的SNP分子标记、其获取方法及应用，通过寻找与高邮鸭肌肉生长性状关联的SNP位点作为分子标记，并将其与体重和肌肉重增长进行关联分析，加快育种进程。

本发明的技术方案如下：