[发明专利]一种基于QPCR定量检测畜禽肉中羊源性成分的方法在审
申请号: | 201810303676.6 | 申请日: | 2018-04-03 |
公开(公告)号: | CN108384863A | 公开(公告)日: | 2018-08-10 |
发明(设计)人: | 赵新;兰青阔;陈锐;王永;朱珠 | 申请(专利权)人: | 天津市农业质量标准与检测技术研究所 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6851;C12N15/11 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 300195 *** | 国省代码: | 天津;12 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 灵敏度 畜禽肉 检测 应用生物信息学 设计通用引物 实时荧光PCR 单拷贝基因 动物基因组 特异性基因 特异性引物 定量分析 定量检测 含量鉴定 基因定量 内参基因 动物源 肉制品 源种 校正 可信 量化 筛选 分析 | ||
1.用于鉴定羊源性成分含量的PCR扩增引物及探针引物,其特征在于,包括内参基因Ref-8引物正向序列:5′-GCTTGAGGGCTGAGTGATAGATTC-3′,Ref-8反向序列:5′-ACACATAAGCTCATCGCAAATCAT-3′,Ref-8探针序列:5′-FAM-CCTGCCTGAAGCATCCCAGTGTGTTT-BHQ1-3′;羊源种属特异性基因Mutton-3引物正向序列:5′-GATCAAAGGCAGAGATTACCAGTCA-3′,Mutton-3反向序列:5′-TTGTGGTTTGTGATTGATTTTAGTCA-3′,Mutton-3探针序列:5′-FAM-TCGCTCTTCCCCTGCTCCAGACAC-BHQ1-3′。
2.一种采用权利要求1所述内参基因和羊源种属特异性基因,快速鉴定羊源性成分含量的方法,其特征在于包括如下步骤:
(1)采用权利要求1所述的内参基因PCR引物和探针及Premix Ex Taq(Probe qPCR)预混液,加入供试样品模板DNA进行PCR扩增;其中的PCR扩增反应体系:扩增反应的总体积为20μL,其各种成分分别为:2×Premix Ex Taq(Probe qPCR)预混液10μL,上下游引物各1μL(浓度为10μmol/L),探针引物0.4μL(浓度为10μmol/L),模板DNA 1μL(浓度为50/μL),用灭菌去离子水补齐至20μL;
反应程序:95℃变性5min;进行45次循环扩增反应(95℃变性15s,60℃退火延伸1min);在第二阶段的退火延伸(60℃)时段收集荧光信号。
(2)构建羊源性成分定量检测标准参照物,采取SDS-硅胶柱改良方法提取DNA梯度稀释,配制标准曲线。标准溶液中羊源性成分的浓度为50、10、5、1、0.5ng/μL,每个反应加入1μL DNA做模板,每个反应分别对应50、10、5、1、0.5ng,每个反应设置3个平行。根据标准DNA溶液PCR反应的Ct值及初始模板浓度的对数分别绘制Ref-8内参基因和Mutton-3羊源特异性基因的标准曲线。
(3)设定阈值后,荧光定量PCR仪的数据分析软件自动计算每个反应的Ct值和靶标浓度,并记录。按照公式A=B/[B+(C-B)/D]×100%,计算出试样中羊源性成分种属特异性基因百分含量。
3.如权利要求2所述的鉴定方法,公式中A为羊源性成分种属特异性基因百分含量,B为Mutton-3羊源种属特异性基因的靶标浓度,C为Ref-8内参基因的靶标浓度,D为羊源性成分中掺入其他动物源性成分的校正系数,即为羊基因组大小/掺入动物基因组大小。
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