[发明专利]一种用于原位无损检测胞外囊泡内核酸分子的探针及其制备方法和应用在审
| 申请号： | 201810291290.8 | 申请日： | 2018-03-30 |
| 公开（公告）号： | CN108642162A | 公开（公告）日： | 2018-10-12 |
| 发明（设计）人： | 罗阳;刘炼华;贾玫;陈晓辉;张洪;邱晓沛;卿光超;刘春姣;王睿璇;周旋 | 申请（专利权）人： | 重庆大学 |
| 主分类号： | C12Q1/6876 | 分类号： | C12Q1/6876;C12Q1/6806 |
| 代理公司： | 北京同恒源知识产权代理有限公司 11275 | 代理人： | 赵荣之 |
| 地址： | 400044 重*** | 国省代码： | 重庆;50 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 核酸分子 探针 外囊 制备方法和应用 多面体骨架 探针结构 无损检测 多面体 核酸 修饰 靶标核酸 淬灭基团 发光基团 设计应用 靶基因 检测 顶角 灵敏 研究 | ||
1.一种用于原位无损检测胞外囊泡核酸分子的多面体探针，其特征在于：包括核酸多面体骨架以及位于多面体顶角的识别靶基因的探针结构，所述探针结构上修饰淬灭基团，所述核酸多面体骨架上修饰发光基团。
2.根据权利要求1所述用于原位无损检测胞外囊泡核酸分子的多面体探针，其特征在于：所述多面体为四面体、六面体或八面体；所述探针结构为茎环结构、三叶草结构、别针结构或者哑铃状结构。
3.根据权利要求1所述用于原位无损检测胞外囊泡核酸分子的多面体探针，其特征在于：所述多面体骨架合成原料为脱氧核糖核苷酸、核糖核苷酸、肽核酸或锁核酸的一种或多种。
4.根据权利要求1所述用于原位无损检测胞外囊泡核酸分子的多面体探针，其特征在于：所述发光基团为Cy3、Cy5、Cy5.5、羧基荧光素、异硫氰酸荧光素、量子点或碳量子点的任意一种；所述淬灭基团可为BHQ-1、BHQ-2、BHQ-3、IOWA、Dabcyl中的任意一种，且其发光基团的发射光谱应该与淬灭基团的吸收光谱部分或者全部重叠。
5.根据权利要求1所述用于原位无损检测胞外囊泡核酸分子的多面体探针，其特征在于：所述多面体骨架由多条相互互补的双链及未配对单碱基构成。
6.根据权利要求1所述用于原位无损检测胞外囊泡核酸分子的多面体探针，其特征在于：待检胞外囊泡内的核酸分子在胞浆内游离存在，为游离cell-free DNA、RNA、microRNA或环状RNA。
7.根据权利要求1所述用于原位无损检测胞外囊泡核酸分子的多面体探针，其特征在于：所述探针结构与多面体骨架相对位置可旋转变化或者探针部分脱离多面体骨架。
8.权利要求1～7任一项所述用于原位无损检测胞外囊泡核酸分子的多面体探针的制备方法，其特征在于：将修饰淬灭基团或淬灭基团的核酸单链加入单链自组装的离子缓冲液中，然后变性后进行退火使其自组装形成多面体探针。
9.权利要求1～7任一项所述用于原位无损检测胞外囊泡核酸分子的多面体探针的制备方法，其特征在于：所述多面体为四面体时核酸单链的核苷酸序列如SEQ ID NO.1～SEQID NO.4所示，SEQ ID NO.1的5'端修饰淬灭基团；所述SEQ ID NO.2～SEQ ID NO.4的5'端修饰有荧光基团；
所述多面体为六面体时核酸单链的核苷酸序列如SEQ ID NO.5～SEQ ID NO.10所示，所述SEQ ID NO.5～SEQ ID NO.8的5'端修饰荧光基团，所述SEQ ID NO.9和SEQ ID NO.10的5'端修饰淬灭基团。
10.权利要求1～7任一项所述多面体探针在制备原位无损检测胞外囊泡核酸分子的试剂中的应用。
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