[发明专利]一种评价三阴性乳腺癌风险评估方法在审

专利信息
申请号: 201810201267.5 申请日: 2018-03-12
公开(公告)号: CN108220445A 公开(公告)日: 2018-06-29
发明(设计)人: 王鹏;裴雨晨;薛梦竹;刘雨薇 申请(专利权)人: 中国科学院上海高等研究院;中国科学院大学
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886
代理公司: 上海光华专利事务所(普通合伙) 31219 代理人: 严晨;许亦琳
地址: 201210 *** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 三阴性乳腺癌 风险评估 预后 基因 样本 淋巴结状态 癌症诊断 临床因素 预测结果 乳腺 预测 阴性 构建 复发 肿瘤 分类 治疗 发现
【说明书】:

发明涉及癌症诊断治疗领域,特别是涉及一种评价三阴性乳腺癌风险评估方法。本发明提供一种评价三阴性乳腺癌风险评估方法,包括:获取样本的17个基因的ERI值;根据各基因的ERI值,获取患者的risk score。本发明的发明人发现通过17个基因的3’UTR构建的预后模型来预测三阴性乳腺的复发和转移风险,其精确程度要高于通过普通临床因素(年龄,淋巴结状态,肿瘤尺寸等)的预测结果,并可根据上述3’UTR的shortening及lengthening这两类分类,进一步预测样本是否属于高风险、预后差或低风险、预后较好的类型。

技术领域

本发明涉及癌症诊断治疗领域,特别是涉及一种评价三阴性乳腺癌风险评估方法。

背景技术

目前癌症是现今危害人们健康的主要病症。乳腺癌则是全球范围内女性最常见的恶性肿瘤之一,也是引起女性死亡的重要原因。在我国,与其他大多数国家一样,乳腺癌也成为了中国女性最常见的癌症;每年中国乳腺癌新发数量和死亡数量分别占世界人口的12.2%与9.6%,每年新发病例约21万,我国乳腺癌发病率增长速度,高出发达国家1-2个百分点。随着新技术新药物等的应用,早期乳腺癌的治愈率可以达到90%,然而仍有30%-40%的患者会死于乳腺癌复发。

肿瘤标识物是可以在血清、血浆、其他体液、组织提取物或石蜡固定的组织中检测到的自然生产的分子,可以为乳腺癌的诊断、治疗方案的选择、疾病进程和复发的预测及治疗效果的监测等提供有价值的信息。乳腺癌作为女性高发恶性肿瘤,非常缺乏高效的肿瘤标识物。目前我国在临床上应用的乳腺癌标识物有雌激素受体(ER)、孕激素受体(PR)和HER2基因,常见的乳腺癌分类也是根据这三个标识物分类的。三阴性乳腺癌是这三种标识物均不表达的一类乳腺癌,也是所有乳腺癌中最难治疗复发率最高的一种。如何对三阴性乳腺癌进行准确的分型、尽早判断肿瘤是否会复发、转移进而选择合理的治疗手段,提高三阴性乳腺癌患者的生存率和生存质量是三阴性乳腺癌治疗的重要的发展方向。

预后是指发病后,疾病未来过程的一种预先估计。在医学上,“预后”是指根据经验预测的疾病发展情况。预后主要涉及到三个方面,将发生什么结果、发生不良结果的可能性有多大、什么时候发生。预后分析是对疾病发病后发展为各种不同结局的预测;是临床非常实用、对临床很有指导作用的临床研究。研究和评级预后的目的,为了便于了解各种疾病对人类危害性的大小、探索影响预后的因素、研究改善预后的具体措施。

可变聚腺苷酸化(Alternative polyadenylation,APA)是一个基础的有关基因调控的分子机制,它通过信使RNA(mRNA)3’端的非编码区来进行生理和病理上的调控。有70%的人类基因有多种polyA位点,可以产生不同长度的3’UTR从而导致转录本的多样化。前期一个关于3’UTR APA dynamics与前列腺癌的研究证明了3’UTR信号可以应用于对肿瘤风险程度的分类。但是在不同3’UTR对肿瘤发病及发展和转移上的研究还是很少。在乳腺癌的研究中,科研人员更多地将注意力集中在短的3’UTR在预后中的显著表现上,而忽略了不同的分子分型间的异质性。

发明内容

鉴于以上所述现有技术的缺点,本发明的目的在于提供一种评价三阴性乳腺癌风险评估方法,用于解决现有技术中的问题。

为实现上述目的及其他相关目的,本发明第一方面提供3’UTR信号作为生物标志物在制备用于评估乳腺癌风险的试剂盒中的用途,

所述3’UTR信号选自如下基因中的一种或多种的3’UTR信号:

SMAD6基因、CXCL8基因、CLIC2基因、PRCKB基因、RTN1基因、ZCCHC14基因、PPIC基因、SIK3基因、UBE2G2基因、SCL2A3基因、SYNGR1基因、NPL基因、PRSS12基因、ADGRL2基因、ZER1基因、WDHD1基因、N4BP2L2基因。

在本发明一些实施方式中,所述乳腺癌选自三阴性乳腺癌。

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