[发明专利]一种鸡体重性状基因诊断试剂盒及其应用

说明书

本发明涉及一种鸡体重性状基因诊断试剂盒及其应用，属于生物育种技术领域。本发明发现QPCTL基因启动子区域的两个分别为52bp和224bp的插入会造成鸡的不同体重的差异，这两种Indels可以作为鸡体重的遗传标记，针对52bp和224bp的插入这一特征，设计基因特异性引物P，PCR反应后进行琼脂糖凝胶电泳，根据琼脂糖凝胶电泳结果准确、快速、方便的检测鸡QPCTL基因启动子不同体重性状的基因型，选择出224bp的纯合插入的基因型个体，从而缩短育种时间，加快育种进程。本发明建立的分子生物学方法大大提高了基因型的判定效率和准确性，方法简单、易操作，且成本低。

技术领域

本发明涉及一种鸡体重性状基因诊断试剂盒及其应用，属于生物育种技术领域。

背景技术

Indel是指在近缘物种或同一物种不同个体之间基因组同一位点的序列发生不同大小核苷酸片段的插入或缺失(insertion/deletion)，是同源序列比对产生空位(gap)的现象。Indel在基因组中分布广泛，在分布密度上仅次于单核苷酸多态性(SNP)，但远高于SSR。Indel多态性分子标记是基于插入/缺失位点两侧的序列设计特异引物进行PCR扩增的标记，其本质仍属于长度多态性标记，可利用便捷的电泳平台进行分型。Indel标记准确性高、稳定性好，分型系统简单，开始应用于动植物群体遗传分析、分子辅助育种、医学诊断等研究领域。人类标记的检测已经成为基因诊断的重要手段，随着位于功能基因上indel标记的开发，结合染色体步移和基因精细定位，可将这些标记应用于农业动物经济性状的功能基因的筛选，有利于优良基因的进一步开发和利用。

中国的地方鸡种生长速度较慢，一直是育种过程中面临的问题。国外商品肉鸡和蛋鸡的选育由来已久，其在控制生长的相关基因上是否与中国地方鸡种具有差异，目前研究还知之甚少。在地方鸡的育种中需要选育出生长速度快的基因型个体，来满足育种的需求。因此利用分子生物手段来诊断某个体与体重相关基因的基因型，这对育种来说是非常重要和必要的。

体重是一种重要的数量性状，在鸡中具有高的遗传性，体重能直接反映营养摄入和支出的平衡，导致瘦肉或脂肪的沉积和骨骼肌的生长。随着家禽遗传标记辅助育种不断深入，大量的性状已经在遗传水平上确定了候选区域。我国有丰富的地方鸡品种资源，如何对其评估、保护和选育是迫切需要解决的问题。QPCTL(Glutaminyl peptidecyclotransferase-like)是QPCT的一种同工酶，QPCTL在人类的肥胖中具有一定的作用，而在家禽动物鸡中发现其在生长发育中可能扮演了重要作用。

发明内容

本发明的目的是提供一种鸡QPCTL基因启动子多态性标记的检测引物，该检测引物特异性强，对鸡QPCTL基因启动子多态性标记扩增效率高。

本发明还提供了包含上述检测引物的检测试剂盒。

本发明还提供了鸡QPCTL基因启动子多态性标记的应用。

为了实现上述目的，本发明所采用的技术方案是：

一种鸡QPCTL基因启动子多态性标记的检测引物，其特征在于：依据如SEQ IDNO.1所示的序列设计，所述检测引物的扩增片段覆盖该序列5‘端起的第20-409位。该引物采用现有技术中常用的设计方法，也可以根据检测方法的不同进行设计。