[发明专利]环状DNA的扩增方法有效
申请号: | 201780034209.1 | 申请日: | 2017-05-17 |
公开(公告)号: | CN109415718B | 公开(公告)日: | 2022-09-27 |
发明(设计)人: | 末次正幸;辻本宽子;篠原赳 | 申请(专利权)人: | 奥利希罗基因组学有限公司 |
主分类号: | C12N15/09 | 分类号: | C12N15/09;C12P19/34 |
代理公司: | 中国贸促会专利商标事务所有限公司 11038 | 代理人: | 郑天松 |
地址: | 日本*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 环状 dna 扩增 方法 | ||
1.环状DNA的扩增方法,其包括以下的工序:
(1)形成成为模板的环状DNA和含以下物质的反应液的反应混合物的工序:
催化环状DNA的复制的第一酶组;
催化冈崎片段连接反应而合成形成环连体的2个姊妹环状DNA的第二酶组;
催化2个姊妹环状DNA的分离反应的第三酶组;
缓冲液;
ATP;
GTP、CTP及UTP;
dNTP;
镁离子源;及
碱金属离子源,
其中所述环状DNA含能与有DnaA活性的酶结合的复制起始序列(origin ofchromosome(oriC));及
(2)将在工序(1)中形成的反应混合物在重复30~80℃的温育及10~27℃的温育的温度循环下温育的工序。
2.权利要求1所述的方法,其中反应液还含蛋白质的非特异吸附抑制剂、及/或核酸的非特异吸附抑制剂。
3.权利要求1所述的方法,其中反应液还含直链状DNA特异性外切核酸酶及/或RecG型解螺旋酶。
4.权利要求1所述的方法,其中反应液还含铵盐。
5.权利要求1所述的方法,其中
第一酶组含具有DnaA活性的酶、1种以上的核样体蛋白质、有DNA促旋酶活性的酶或酶组、单链DNA结合蛋白质(single-strand binding protein(SSB))、有DnaB型解螺旋酶活性的酶、有DNA解螺旋酶装载体活性的酶、有DNA引发酶活性的酶、有DNA夹活性的酶、及有DNA聚合酶III*活性的酶或酶组的组合,
第二酶组含具有DNA聚合酶I活性的酶及有DNA连接酶活性的酶的组合,
第三酶组含具有拓扑异构酶III活性的酶及/或有拓扑异构酶IV活性的酶。
6.权利要求5所述的方法,其中第二酶组还含具有RNA酶H活性的酶。
7.权利要求5所述的方法,其中第三酶组还含具有RecQ型解螺旋酶活性的酶。
8.权利要求5所述的方法,其中在第一酶组中,
1种以上的核样体蛋白质是IHF或HU,
有DNA促旋酶活性的酶或酶组是由GyrA及GyrB构成的复合物,
有DnaB型解螺旋酶活性的酶是DnaB解螺旋酶,
有DNA解螺旋酶装载体活性的酶是DnaC解螺旋酶装载体,
有DNA引发酶活性的酶是DnaG引发酶,
有DNA夹活性的酶是DnaN夹,
有DNA聚合酶III*活性的酶或酶组是含DnaX、HolA、HolB、HolC、HolD、DnaE、DnaQ、及HolE之任一者的酶或酶组。
9.权利要求1所述的方法,其中反应液还含RecG型解螺旋酶及/或单链DNA特异性外切核酸酶。
10.权利要求1所述的方法,其中反应液还含直链状DNA特异性外切核酸酶及/或单链DNA特异性外切核酸酶。
11.权利要求1所述的方法,其中反应液还含DNA的稳定化因子。
12.权利要求1所述的方法,其中工序(1)包括:
(1-1)对含以下物质的反应液进行预温育的工序:
催化环状DNA的复制的第一酶组;
催化冈崎片段连接反应而合成形成环连体的2个姊妹环状DNA的第二酶组;
催化2个姊妹环状DNA的分离反应的第三酶组;
缓冲液;
ATP;
GTP、CTP及UTP;
dNTP;
镁离子源;及
碱金属离子源;及
(1-2)形成所述反应液和成为模板的环状DNA的反应混合物的工序。
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