[发明专利]与脂尾型绵羊的尾型性状相关的SNP标记及应用有效
申请号: | 201711476654.1 | 申请日: | 2017-12-29 |
公开(公告)号: | CN108384859B | 公开(公告)日: | 2021-09-24 |
发明(设计)人: | 曹贵方;智达夫;刘默凝;王鑫;龙鑫 | 申请(专利权)人: | 内蒙古农业大学 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12N15/11 |
代理公司: | 天津市杰盈专利代理有限公司 12207 | 代理人: | 赵敬 |
地址: | 010018 内蒙古自*** | 国省代码: | 内蒙古;15 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 脂尾型 绵羊 性状 相关 snp 标记 应用 | ||
一种与脂尾型绵羊的尾型性状相关的SNP标记及应用,属生物领域,该SNP标记位于绵羊第8号染色体第87804589碱基对,该位置碱基为T的绵羊具有短尾性状,此处碱基为G时拥有正常尾长。本发明还提供了检测SNP标记的引物及含有该引物的试剂盒,采用聚合酶链式反应(PCR)和测序技术筛选到与脂尾型绵羊尾型性状相关的SNP标记,并通过限制片段多态性(RFLP)方法来检测待测绵羊的基因型。及SNP标记在鉴定脂尾型绵羊尾型性状中的应用和在中国绵羊育种中的应用。根据基因型进行脂尾型绵羊尾型性状优势品种的选育,从而加快脂尾型绵羊的育种进程。
技术领域
本发明涉及一种与脂尾型绵羊的尾型性状相关的SNP标记及应用。
背景技术
随着人们对羊肉需求上升,养羊业也早已成为畜牧生产非常重要的组成部分。在内蒙古乃至我国的养羊产业中,一个重要的问题是羊尾巴脂肪沉积问题。全世界大约有25%的绵羊品种属于脂尾(臀)型(fat tail/fat rump)绵羊品种,这类品种具有超强的尾部脂肪沉积能力,一些品种如大尾寒羊尾脂含量甚至超过总胴体重的25%。改革开放前,羊尾脂肪,作为食用油脂被食用。而现在羊尾脂肪已经很少用于食用,高脂肉类逐渐受到冷落,大脂尾型绵羊品种从饲养成本、效益的角度考虑,也难以更好推广。有学者研究,生产1kg脂肪消耗的饲草可产生2kg瘦肉,显然过多的尾脂沉积会加大饲养成本。从经济角度来说,每只羊臀部及尾部沉积脂肪少则3-4kg,多则7-8kg,因此羊肉加工企业在收购胴体羊时一般都要去除羊尾巴后再计算价格收购,造成养殖户效益损失。此外,牧民已经结束游牧状态,定居后,羊场圈舍保温措施得以加强,绵羊尾脂的“能量蓄积”、“保命”作用也已经淡化。因此在肉羊饲养过程中,养殖短尾羊、或者人为去除羊尾(断尾)逐渐成为养羊业必然选择,短尾或者“断尾”还可以利于生殖交配和减少生殖道寄生虫等疫病发生。由于“断尾”在自然放牧的草原地区增加了劳动量,对于羊本身也是十分痛苦的,动物福利一直受到质疑。此外,在北方寒冷地区,按照人工断尾方法,完全去除尾部,会导致肛门、外阴等暴露,产生冻疮,夏季易生寄生虫等。因此,脂尾型短尾羊培育成为未来肉羊育种的重要发展方向。
单核苷酸多态性标记(SNP)主要是指在基因组脱氧核酸(DNA)序列上由单个脱氧核苷酸的变异所引起的DNA片段的多态性。SNP的多态性仅涉及到单个碱基的变异,表现的形式有替换、插入和缺失等。SNP的检测方法,目前常用的包括:Sanger测序、DNA芯片、飞行时间质谱、以及最新的高通量二代测序等技术。通过检测单核苷酸多态性标记检测基因型是近些年兴起的一种方法。SNP作为遗传标记已经广泛地应用于基因定位、克隆、遗传育种以及遗传多样性等研究领域。分子标记在动物育种中的应用已有一段时间,相比传统育种方法,分子育种大大加快了选育效率,节省了育种时间,使得育种学家可以在分子水平上不断探索并选育更优良的家畜品种。
发明内容
本发明的目的是提供一种与脂尾型绵羊的尾型性状相关的SNP标记及应用。
本发明的另一目的是提供检测该分子标记的试剂盒。
本发明的再一目的是提供鉴定脂尾型绵羊尾型性状的方法。
为了实现本发明的目的,本发明提供了一种与脂尾型绵羊的尾型性状相关的SNP标记,其特征在于:其核苷酸序列如序列1所示,在该序列的第186bp的碱基为G或T。
本发明的与脂尾型绵羊的尾型性状相关的SNP标记,其特征在于:通过序列表的序列2所示的单链DNA分子和序列表的序列3所示的单链DNA分子组成的特异引物对扩增获得。
本发明提供了上述SNP标记在鉴定脂尾型绵羊尾型性状中的应用。
进一步地,当绵羊T基因如序列1所述186bp处,即8号染色体第87804589bp处,该位置碱基为 T 的绵羊具有短尾性状,此处碱基为G时拥有正常尾长。
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