[发明专利]绵羊B4GALNT2基因全长序列的扩增及其表达量的检测有效

专利信息
申请号: 201711405165.7 申请日: 2017-12-22
公开(公告)号: CN108085324B 公开(公告)日: 2020-08-25
发明(设计)人: 储明星;郭晓飞;王翔宇;狄冉;刘秋月;胡文萍;梁奔梦;李晓雨;贺小云 申请(专利权)人: 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
主分类号: C12N15/54 分类号: C12N15/54;C12N15/113;C12Q1/686;C12Q1/6851
代理公司: 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 代理人: 王文君;王璐
地址: 100193 *** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 绵羊 b4galnt2 基因 全长 序列 扩增 及其 表达 检测
【权利要求书】:

1.绵羊B4GALNT2基因,其特征在于,其核苷酸序列或其反义核苷酸序列如SEQ ID NO.1或SEQ ID NO.2所示。

2.一种绵羊B4GALNT2基因的扩增方法,其特征在于,包括如下步骤:

(1)经体外培养3天的绵羊颗粒细胞通过RNA提取试剂盒提取其总RNA,并分别按照Takara公司的Prime Script RT reagent Perfect Real Time试剂盒和SMARTer RACE 5’/3’Kit User Manual试剂盒说明书合成普通cDNA模板、5’cDNA第一链模板和3’cDNA第一链模板;

(2)利用步骤(1)所获得的普通cDNA为模板,以6对扩增引物,通过普通PCR方法扩增B4GALNT2基因的各保守区序列;

所述6对扩增引物如下:

上游引物F1:ACCACTCCTTCAGCCTAGTG;

下游引物R1:TCATCGTCCACCCAGAGAAC;

上游引物F2:CAGACTGAACTCCCTGCGGTGA;

下游引物R2:CACATCCAGTTCGGTCTTCTC;

上游引物F3:AAGATTGAGGTGCTGGTGGA;

下游引物R3:TGCCCTGATCAGTGATTGGT;

上游引物F4:CAGCCCTGGAGAAGACCTAC;

下游引物R4:CCCACGCTCTGATCCTCTAA;

上游引物F5:CTTGAGGAAGTGGCAGTCTG;

下游引物R5:GCCACTGCGCTTACAAAGTA;

上游引物F6:ATGGGATGCAAGAAGGTGGA;

下游引物R6:TTTTGACCTACCGTGGCTGT;

(3)利用步骤(1)所获得的5’cDNA第一链为模板,以5’GSP1和5’GSP2为扩增引物,通过降落PCR方法扩增B4GALNT2基因的5’端序列;

5’GSP1:AGAGGCTCTTGATGTGTTTCTCAGGGAG;

5’GSP2:CCCAGGGCCAAGAATAAGACGGACATC;

(4)利用步骤(1)所获得的3’cDNA第一链为模板,以3’GOP为扩增引物,通过降落PCR方法扩增B4GALNT2基因的3’端序列,再以所获得的降落PCR产物为模板,以3’GIP为巢式引物,进行巢式PCR扩增;

3’GIP:TGGGATGCAAGAAGGTGGAGGGCAGAG;

3’GOP:GATTCTCCCACTGCTGCGCTGCCTTTT;

(5)上述步骤(2)、(3)和(4)中最终所获得的PCR扩增产物通过琼脂糖凝胶电泳检测,均经切胶纯化后连接到pMD18-T载体,转化到DH5α感受态细胞中,挑选阳性质粒,再通过琼脂糖凝胶电泳鉴定获得所需目的条带,通过Sanger测序得到绵羊B4GALNT2各保守区序列、5’端序列和3’端序列片段信息;

(6)将步骤(5)中扩增得到B4GALNT2的各保守区序列、5’端序列和3’端序列片段通过DNAMAN软件进行序列拼接,得到绵羊B4GALNT2基因mRNA全长序列。

3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,步骤(2)中的普通PCR扩增程序为:95℃、5min,33×[95℃、30s,退火温度、30s,72℃、45s],72℃、8min,4℃保存。

4.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,步骤(3)中的降落PCR扩增程序为:95℃、5min,10×[95℃、30s,72-0.4℃、30s,72℃、3min],25×[95℃、30s,68℃、30s,72℃、3min],72℃、8min,4℃保存。

5.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,步骤(4)中的降落PCR扩增程序为:95℃、5min,10×[95℃、30s,72-0.4℃、30s,72℃、3min],25×[95℃、30s,68℃、30s,72℃、3min],72℃、8min,4℃保存;步骤(4)中的巢式PCR扩增程序为:95℃、5min,25×[95℃、30s,68℃、30s,72℃、3min],72℃、8min,4℃保存。

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