[发明专利]绵羊B4GALNT2基因全长序列的扩增及其表达量的检测有效
申请号: | 201711405165.7 | 申请日: | 2017-12-22 |
公开(公告)号: | CN108085324B | 公开(公告)日: | 2020-08-25 |
发明(设计)人: | 储明星;郭晓飞;王翔宇;狄冉;刘秋月;胡文萍;梁奔梦;李晓雨;贺小云 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 |
主分类号: | C12N15/54 | 分类号: | C12N15/54;C12N15/113;C12Q1/686;C12Q1/6851 |
代理公司: | 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 | 代理人: | 王文君;王璐 |
地址: | 100193 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 绵羊 b4galnt2 基因 全长 序列 扩增 及其 表达 检测 | ||
1.绵羊B4GALNT2基因,其特征在于,其核苷酸序列或其反义核苷酸序列如SEQ ID NO.1或SEQ ID NO.2所示。
2.一种绵羊B4GALNT2基因的扩增方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)经体外培养3天的绵羊颗粒细胞通过RNA提取试剂盒提取其总RNA,并分别按照Takara公司的Prime Script RT reagent Perfect Real Time试剂盒和SMARTer RACE 5’/3’Kit User Manual试剂盒说明书合成普通cDNA模板、5’cDNA第一链模板和3’cDNA第一链模板;
(2)利用步骤(1)所获得的普通cDNA为模板,以6对扩增引物,通过普通PCR方法扩增B4GALNT2基因的各保守区序列;
所述6对扩增引物如下:
上游引物F1:ACCACTCCTTCAGCCTAGTG;
下游引物R1:TCATCGTCCACCCAGAGAAC;
上游引物F2:CAGACTGAACTCCCTGCGGTGA;
下游引物R2:CACATCCAGTTCGGTCTTCTC;
上游引物F3:AAGATTGAGGTGCTGGTGGA;
下游引物R3:TGCCCTGATCAGTGATTGGT;
上游引物F4:CAGCCCTGGAGAAGACCTAC;
下游引物R4:CCCACGCTCTGATCCTCTAA;
上游引物F5:CTTGAGGAAGTGGCAGTCTG;
下游引物R5:GCCACTGCGCTTACAAAGTA;
上游引物F6:ATGGGATGCAAGAAGGTGGA;
下游引物R6:TTTTGACCTACCGTGGCTGT;
(3)利用步骤(1)所获得的5’cDNA第一链为模板,以5’GSP1和5’GSP2为扩增引物,通过降落PCR方法扩增B4GALNT2基因的5’端序列;
5’GSP1:AGAGGCTCTTGATGTGTTTCTCAGGGAG;
5’GSP2:CCCAGGGCCAAGAATAAGACGGACATC;
(4)利用步骤(1)所获得的3’cDNA第一链为模板,以3’GOP为扩增引物,通过降落PCR方法扩增B4GALNT2基因的3’端序列,再以所获得的降落PCR产物为模板,以3’GIP为巢式引物,进行巢式PCR扩增;
3’GIP:TGGGATGCAAGAAGGTGGAGGGCAGAG;
3’GOP:GATTCTCCCACTGCTGCGCTGCCTTTT;
(5)上述步骤(2)、(3)和(4)中最终所获得的PCR扩增产物通过琼脂糖凝胶电泳检测,均经切胶纯化后连接到pMD18-T载体,转化到DH5α感受态细胞中,挑选阳性质粒,再通过琼脂糖凝胶电泳鉴定获得所需目的条带,通过Sanger测序得到绵羊B4GALNT2各保守区序列、5’端序列和3’端序列片段信息;
(6)将步骤(5)中扩增得到B4GALNT2的各保守区序列、5’端序列和3’端序列片段通过DNAMAN软件进行序列拼接,得到绵羊B4GALNT2基因mRNA全长序列。
3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,步骤(2)中的普通PCR扩增程序为:95℃、5min,33×[95℃、30s,退火温度、30s,72℃、45s],72℃、8min,4℃保存。
4.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,步骤(3)中的降落PCR扩增程序为:95℃、5min,10×[95℃、30s,72-0.4℃、30s,72℃、3min],25×[95℃、30s,68℃、30s,72℃、3min],72℃、8min,4℃保存。
5.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,步骤(4)中的降落PCR扩增程序为:95℃、5min,10×[95℃、30s,72-0.4℃、30s,72℃、3min],25×[95℃、30s,68℃、30s,72℃、3min],72℃、8min,4℃保存;步骤(4)中的巢式PCR扩增程序为:95℃、5min,25×[95℃、30s,68℃、30s,72℃、3min],72℃、8min,4℃保存。
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