[发明专利]一种与绵羊尾型相关的SNP分子标记及其应用

说明书

本发明提供了检测绵羊尾型的SNP分子标记，位于第13号染色体第49051930处，其SNP分子标记的多态性为C/G；位于第13号染色体49132297处；其SNP分子标记的多态性为A/G。上述SNP分子标记可用于鉴定绵羊尾型和选育瘦尾型绵羊。

技术领域

本发明属于遗传生物学领域，具体涉及一种与绵羊尾型相关的SNP分子标记及其应用。

背景技术

在绵羊中，尾巴的形态分为脂尾和瘦尾。脂尾大且内部包含大量脂肪，瘦尾小而含脂肪量少。

尾脂是绵羊特有的储能方式，在春秋季节，草原草木丰盛，绵羊通过大量进食，将能量转化成脂肪储存在尾巴上，形成尾脂，等到冬季来临，草原草木枯竭，这时利用尾中的储存脂肪提供能量，以度过寒冷的冬天，生存下来。然而随着人们对羊肉的需求量越来越大，对尾脂的需求越来越少，尾脂又占有了大量机能，造成了大量的能源浪费，限制着集约化养殖，不利于肉羊产业的发展。而我国绵羊系全是尾脂系，要想改变该性状，唯一的方法是找到该性状功能基因，通过分子育种技术改变该性状，因此，应用遗传学方法寻找该性状的功能基因。

虽然脂尾和瘦尾是极其显著明显的性状，但是控制其尾脂沉积的基因仍知之甚少，因此随后研究人员为了寻找控制脂尾和瘦尾的基因，做了大量工作。2012年，Moradi等（Moradi M H, Nejatijavaremi A, Moradishahrbabak M, et al. Genomic scan ofselective sweeps in thin and fat tail sheep breeds for identifying ofcandidate regions associated with fat deposition. BMC Genetics, 2012, 13(1):1-15.）利用50 K高密度芯片对伊朗脂尾和瘦尾型绵羊的研究表明，在2、3、5、7和X染色体上的部分区域有大量SNP在脂尾型绵羊和瘦尾型绵羊之间存在明显差异。随后在我国的地方绵羊中检测了Moradi报道的位点，发现绵羊X染色体60149273位点（甘尚权, 沈敏, 李欢,et al. X染色体60149273位点在脂尾(臀)和瘦尾绵羊品种中的多态性及其基因定位. 中国农业科学, 2013, 46(22): 4791-4799.）、59383635位点（甘尚权, 张伟, 沈敏, 等. 绵羊X染色体59383635位点多态性与脂尾性状的相关性分析. 遗传, 2013, 35(10): 1209-1216.）、59257971位点（甘尚权, 张伟, 宋天增, 等. X染色体一处新发现的SNP位点在脂尾(臀)、瘦尾绵羊群体中的多态检测及分析. 西南农业学报, 2013, 26(5): 2066-2070.）、59571364位点和59912586位点（张伟, 沈敏, 李欢,等. 绵羊X染色体59571364与59912586位点在脂尾、瘦尾绵羊群体中的多态性检测及分析. 遗传, 2013, 35(12):1384-1390.）、7号染色体上46843356位点（张伟, 蒋曙光, 沈敏, 等. 绵羊 7 号染色体46843356 位点多态性与尾脂沉积相关性研究. 畜牧与兽医, 2014, 46(4): 25-29.），在脂尾和瘦尾羊中基因型频率存在显著性差异。杜立新（Wei C H, Wang H H, Liu G, etal. Genome-wide analysis reveals population structure and selection inChinese indigenous sheep breeds. BMC Genomics, 2015, 16.）通过50K芯片对中国的脂尾羊和瘦尾藏羊进行研究发现了PDGFD基因受到强烈的选择，可能影响了脂尾的脂肪代谢。

但目前无关于脂尾/瘦尾在同一种群中的SNP关联分析，也无关于脂尾瘦尾直接相关的SNP分子标记报道。

发明内容

针对缺乏关于脂尾/瘦尾直接相关的SNP分子标记等问题，本发明提供一种检测绵羊尾脂的SNP分子标记。

本发明的另一目的是提供一种检测绵羊尾型SNP分子标记的特异引物。