[发明专利]猪多组学整合精准育种方法

权利要求书

1.猪多组学整合精准育种方法，其特征在于，所述育种方法包括测定HSD17B1基因表达量、以及HSD17B1基因上SNP位点上基因型的步骤；

通过测定猪HSD17B1基因mRNA的表达量，判定猪产仔性状：HSD17B1基因mRNA的表达量越低，猪具有更高的产仔数和窝重；

所述SNP位点位于猪HSD17B1基因第323407415位，该SNP位点的两种等位基因为A或G；

SNP位点对应的三种基因型分别为AA、GG和AG，AA基因型为猪HSD17B1基因第323407415位脱氧核糖核苷酸为A的纯合体；GG基因型为猪HSD17B1基因第323407415位脱氧核糖核苷酸为G的纯合体；AG基因型为猪HSD17B1基因第323407415位脱氧核糖核苷酸为A与G的杂合体；

通过测定猪HSD17B1基因第323407415位SNP位点对应的三种基因型，判定猪产仔性状：基因型为AG和GG的猪相较于基因型为AA的猪有更高的产仔数和窝重；

所述育种猪为大白猪和/或梅山猪。

2.根据权利要求1所述的育种方法，其特征在于，所述育种方法中通过获得猪卵巢组织细胞的总RNA，经反转录、定量PCR确定猪HSD17B1基因mRNA的表达量。

3.根据权利要求2所述的育种方法，其特征在于，定量PCR步骤中，包括用于扩增HSD17B1基因mRNA反转录产物的扩增引物P₃和P₄，所述扩增引物P₃和P₄的核苷酸序列分别包括SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3所示序列。

4.根据权利要求1所述的育种方法，其特征在于，用以检测所述SNP位点的方法中包括一组扩增引物P₁和P₂、以及延伸引物，

所述扩增引物P₁和P₂的核苷酸序列分别包括SEQ ID NO.4和SEQ ID NO.5所示序列。

5.根据权利要求4所述的育种方法，其特征在于，所述延伸引物的核苷酸序列分别包括SEQ ID NO.6所示序列。

6.根据权利要求1所述的育种方法，其特征在于，SNP位点处基因型的测定方法包括：

方法1，检测猪HSD17B1基因第323407415位脱氧核糖核苷酸为A或G、或A和G，以确定待测猪的基因型是AA、GG或AG；和/或

方法2，通过Sequenom MassArray方法直接确定基因型。

7.根据权利要求1所述的育种方法，其特征在于，所述育种方法包括以下步骤：

步骤1，选择HSD17B1基因mRNA低表达量、且HSD17B1基因第323407415位为GG或AG基因型的猪作为亲本杂交，获得F1代仔猪；

步骤2，对F1代仔猪进行HSD17B1基因mRNA定量分析、以及第323407415位基因型确定，选育HSD17B1基因mRNA的低表达量、且第323407415位为GG或AG基因型的仔猪，成年后继续杂交得F2代仔猪；

步骤3，对F2代仔猪进行HSD17B1基因mRNA定量分析、以及第323407415位基因型确定，选育HSD17B1基因mRNA的低表达量、且第323407415位为GG或AG基因型的仔猪，成年后继续杂交得F3代仔猪；

重复上述步骤2或3，最终得到HSD17B1低表达量、基因型GG的高产仔数和/或窝重的种猪。