[发明专利]马铃薯A病毒鉴定用的引物、试剂盒及鉴定方法在审
申请号: | 201710633014.0 | 申请日: | 2017-07-28 |
公开(公告)号: | CN108251555A | 公开(公告)日: | 2018-07-06 |
发明(设计)人: | 陈定虎;单振菊;杨雷亮;王章根 | 申请(专利权)人: | 陈定虎 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6844;C12N15/11;C12R1/94 |
代理公司: | 中山市兴华粤专利代理有限公司 44345 | 代理人: | 吴剑锋 |
地址: | 528400*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 引物 试剂盒 马铃薯A病毒 目视检测 去离子水 特异性强 引物BIP 引物FIP 缓冲液 灵敏性 酶溶液 荧光 | ||
1.一种马铃薯A病毒鉴定用的引物,其特征在于包括:
PVA-FIP:
5’-CTTGCATCAAGAGTTTCGGCTT-GATGAACAAATGGATGAAGAAGA-3’
PVA-BIP:5’-CGAAGCACTGCGCAGAAATC-TTGTCCTTCACGGCTACA-3’
PVA-F3:5’-TGGAAAAGTACTCTATCCAGTT-3’
PVA-B3:5’-CTGAATGACAGCAATAACGA-3’
PVA-LB:5’-TGAGTAGGCAGAAAGAGGAGAA-3’。
2.一种马铃薯A病毒鉴定用的试剂盒,其特征在于该试剂盒包括有:
3.根据权利要求2所述马铃薯A病毒鉴定用的试剂盒,其特征在于所述的2×反应液缓冲液由以下组分组成:
4.一种马铃薯A病毒鉴定方法,其特征在于包括以下步骤:
A、植物组织总DNA提取;
B、LAMP检测:
采用权利要求2所述的试剂盒配置预反应溶液,在预反应溶液中分别加入待检测的样品的DNA 5μL,使总量达到25μL;其中对照组在预反应溶液加入去离子水5μL;阳性对照在预反应溶液中加入带病毒的DNA 5μL;用移液器吸排液法混合,或者合上盖子轻击使溶液充分混合后瞬时离心,混合时避免产生气泡;将混合物置于反应孔中,于65℃恒温反应90min,最后80℃下保温5min以结束反应;
C、LAMP结果判断
扩增反应结束后,使用紫外线照射装置,波长240-260nm,350-370nm,从反应试管底部向上进行紫外线照射,佩戴眼镜等防护用具后从反应试管侧面进行观察,若与阳性对照一样发出绿色荧光,则判定为阳性即样品中带有马铃薯A病毒;若与阴性对照一样未发出绿色荧光,则判定样品中没有携带马铃薯A病毒。
5.根据权利要求4所述的鉴定方法,其特征在于步骤A中植物组织总DNA提取的具体步骤:
a.取0.1g植物组织置于液氮中研磨,时间尽量短,保持研钵中有液氮;
b.转移样品到1.5mL Rnase free离心管中,加入1mL的PL裂解液颠倒混匀,65℃条件下进行孵育5min,使核蛋白体分解完全;
c.室温条件下12000rpm离心10min后,取上清转入新的RNase free过滤柱中;
d.10000rpm离心45s,收集下滤液于收集管中,进行下一步的操作;
e.收集管中加入1倍体积的70%乙醇,颠倒进行混匀,得到的溶液以及沉淀一起转移到吸附柱RA中,量太多可分次进行过柱;
f.10000rpm下离心45s,弃掉废液后,重新将吸附柱放回收集管中;
g.加入500μL去蛋白液RE,12000rpm下离心45s,废液弃掉;
h.加入700μL漂洗液RW,12000rpm下离心60s,废液弃掉;
i.加入500μL漂洗液RW,12000rpm下离心60s,废液弃掉;
j.将吸附柱RA重新放回收集管中,12000rpm离心2min,除去漂洗液,以免抑制下游反应;
k.取出吸附柱RA,取一个新的RNase free离心管中放入,根据所预期基因组和RNA的产量在吸附膜中间部位加50-80μL RNase free water,室温下放置2min后12000rpm离心1min。
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