[发明专利]一种PCR无效扩增的检测方法在审
申请号: | 201710591808.5 | 申请日: | 2017-07-19 |
公开(公告)号: | CN107312850A | 公开(公告)日: | 2017-11-03 |
发明(设计)人: | 程标;相双红 | 申请(专利权)人: | 华东医药(杭州)基因科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/10 |
代理公司: | 杭州求是专利事务所有限公司33200 | 代理人: | 黄欢娣,邱启旺 |
地址: | 310000 浙江省杭*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 pcr 无效 扩增 检测 方法 | ||
1.一种PCR无效扩增的检测方法,其特征在于,该方法根据PCR反应荧光强度检测结果,通过第一阈值和第二阈值检测出假阳性、假阴性及波动超限产生的无效扩增。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述第一阈值R1为至少包含3个循环周期的荧光信号标准偏差的3~15倍,起始周期为第2~10个循环周期,结束周期为第10~25个循环周期;或为第Cn个周期的荧光强度值,第Cn个周期的荧光强度值满足:
其中Cn代表扩增周期,R是对应扩增周期的荧光强度值。
3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述第一阈值R1为至少包含3个循环周期的荧光信号标准偏差的10倍。
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述第二阈值R2为终点荧光检测的阴阳分割值。
5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,无效扩增的检测方法如下:
若终点阈值R>R2时,判定为待定阳性;将阈值线y=R1与阈值线y=R2之间增长区的最大斜率Ki与扩增效率K(K为PCR扩增实测值)值进行比较,当Ki>=K时,判定为阳性,否则为假阳性;
若终点阈值R<R1时,判定为阴性;
若终点阈值R1=<R<=R2时,判定为待定阴性。将阈值线y=R1与阈值线y=R2之间增长区的最大斜率Ki与扩增效率K值进行比较,当Ki<=K时,判定为阴性,否则为假阴性;
假阴性和假阳性均为无效扩增。
若扩增曲线在扩增结束前L个周期之间的荧光值波动大于这L个周期的荧光值均方差的2~5倍,L取3‐15,则判定为波动无效扩增。
若扩增曲线在扩增的3‐15个循环周期之间,其中,起始周期为第2~10个循环周期,结束周期为第10~25个循环周期,荧光值恒定且高于第一阈值线R1,则判定该扩增为无效扩增。
6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,L为5个,扩增曲线在扩增结束前5个周期之间的荧光值波动大于这5个周期的荧光值均方差的3倍,则为无效扩增。
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