[发明专利]一种鉴定番茄果实干汁性状的差异性序列及其分子标记物与鉴定方法

说明书

本发明公开了一种番茄果实干汁性状的差异性序列，该序列如SEQ ID NO：1所示，还提供了鉴定上述性状的方法与分子标记物，包括如核苷酸序列SEQ ID NO：2所示的上游引物，如核苷酸序列SEQ ID NO：3所示的下游引物，并提供了鉴定上述性状的方法：(1)以待鉴定番茄的基因组DNA为模板，用所述分子标记物进行PCR扩增；(2)对扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳检测，如果待鉴定番茄的PCR扩增产物含有如SEQ ID NO：1所示的DNA片段，则即可鉴定出该待鉴定番茄为有汁番茄，反之则为干汁番茄。利用本发明进行番茄果实干汁性状的分子标记辅助选择，可提高选择效率，加快育种进程；本发明只需通过简单的DNA提取、PCR特异性扩增、琼脂糖凝胶电泳检测即可完成对样品的鉴别。

技术领域

本发明属于遗传学与生物学技术领域，具体为番茄果实干汁性状的差异性基因序列与及其分期标记引物与鉴定方法。

背景技术

番茄具有较高的营养价值和经济价值，是重要的鲜食产品和加工原料，已成为继玉米、水稻、小麦与马铃薯等之后的世界第七大作物，全球年工业产值可达500亿美元。番茄果实不仅含有对人体有益的碳水化合物、纤维素和矿质元素等，并且含有多种维生素，以及决定果实风味的多种糖、有机酸和挥发性有机化合物。番茄因其重要的农业价值、丰富的营养价值、优越的植物学特性和基础研究优势，成为研究肉质果特别是肉质浆果及其发育的模式植物。解释了众多果实的生理、发育和代谢等机理，如关于肉质果实的器官发生、发育和成熟，以及感官品质和营养的分子基础等。

利用不断发展的理论和技术，培育满足生产和市场需求的优良品种，是番茄育种的根本目的。随着遗传学的发展，遗传标记的得到广泛应用和推广，分为形态标记、细胞学标记、生化标记等表现型标记和DNA片段标记等基因型标记。DNA片段标记能够直接反映生物个体或种群间基因组的某种差异，具有不受环境和基因表达的影响，而且具有数量丰富，遗传稳定，操作简单等优点。从20世纪80年代后期开始，分子标记辅助选择技术和基因工程技术为核心的生物育种技术得到了快速的发展。常用的分子标记有基于Southern杂交的限制性片段长度多态性标记(RFLP)，基于PCR技术的DNA扩增方法的随机扩增多态性DNA标记(RAPD)，特定序列扩增标记(SCAR)和简单重复序列标记(SSR)，以及基于PCR与酶切相结合的扩增片段长度多态性标记(AFLP)、切割扩增的多态性序列标记(CAPS)和单核苷酸多态性(SNP)等。PCR是聚合酶链式反应的英文缩写(Polymerase Chain Reaction)，PCR反应可以扩增一个DNA片段。PCR技术已经被广泛用于生物学、分子生物学、生物化学、生物医学等学科。

普通番茄成熟后，果实心室组织发育成凝胶状的心室胶状物(loculargel)。心室胶状物是番茄等肉质浆果的典型特征，对果实的形成、发育、风味组成与质地变化等均发挥着重要作用。心室胶状物作为番茄果实中除果皮外的第二大丰富组织，是风味品质的重要构成因素。干汁番茄材料(allflesh，alf)果实不形成心室胶状物，果实仍能正常发育成熟，干汁番茄果实干物质含量高，可提高果实的耐贮运性，减缓番茄切片的降解速度，用于制干番茄及汉堡夹心等。干汁番茄材料的研究可为深入理解番茄风味品质的形成及遗传改良提供理论依据，并可为解析番茄果实心室胶状物的形成和发育的分子机制奠定基础。然而，现有技术中采用分子技术直接鉴定番茄是否为干汁番茄却显有报道。

发明内容

为解决现有技术中上述问题，本发明提供了番茄果实干汁性状的差异性序列及其分子标记物与鉴定方法，实现的目的为，提供一种在番茄苗期快速筛选和鉴定番茄果实干汁性状的方法和检测技术，可于植株早期快速稳定地筛选和鉴定番茄果实的干汁性状。

为了实现上述目的，本发明公开的技术方案为：本发明提供了一种番茄果实干汁性状的差异性序列，该序列如SEQ ID NO：1所示。

本发明还公开了鉴定番茄果实干汁性状的分子标记物，该分子标记物包括上游引物、下游引物，上游引物的的核苷酸序列如SEQ ID NO：2所示，下游引物的核苷酸序列如SEQID NO：3。