[发明专利]检测人体CYP3A4代谢酶表达用的LncRNAs生物标志物及其检测引物和检测方法有效
申请号: | 201710426234.6 | 申请日: | 2017-06-01 |
公开(公告)号: | CN108977522B | 公开(公告)日: | 2021-11-23 |
发明(设计)人: | 张利荣;韩圣娜;聂亚莉;闫良;刘婧阳;孟祥光 | 申请(专利权)人: | 郑州大学 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12N15/11 |
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地址: | 450001 河南*** | 国省代码: | 河南;41 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 人体 cyp3a4 代谢 表达 lncrnas 生物 标志 及其 引物 方法 | ||
1.检测人体CYP3A4代谢酶表达用的LncRNAs生物标志物,其特征在于,所述LncRNAs生物标志物包括:HNF1A-AS1和NONHSAT031260,其中,
所述HNF1A-AS1的核苷酸序列如序列表中SEQ ID NO.4所示;
NONHSAT031260的核苷酸序列如序列表中SEQ ID NO.5所示。
2.检测权利要求1所述的LncRNAs生物标志物的方法,其特征在于,包括以下步骤:
Step1:抽提肝脏组织总RNA;
Step2:将mRNA反转录成cDNA;
Step3:以GAPDH为内参基因,进行QPCR反应,具体如下
(1)引物设计如下:
(2)反应体系如下:
反应程序设置为:50℃2min,95℃2min;95℃15s,60℃1min,循环数为40;
溶解曲线反应为:95℃15s,60℃ 1min,95℃15s,60℃ 15s;
在每个循环退火与延伸时读取荧光强度;
Step4:对Real-time PCR数据进行分析,Real-time PCR数据以荧光强度ΔRn与循环数表示,logΔRn对循环数函数的中间值设为阈值,当某个样品的ΔRn值与该阈值有交点时,交点处的循环数记为Ct,采用相对定量的方法检测成人肝脏组织中HNF1A-AS1和NONHSAT031260的表达水平,目的基因cDNA相对于内参GAPDH增加的倍数用下面的公式表示:
变化倍数=2-ΔΔCt,
ΔΔCt=(Ct目的-CtGAPDH)Tx-(Ct目的-CtGAPDH)T0
其中,Tx表示任意时间点,T0表示起始时间点;
Step5:用标准曲线来检测用2-ΔΔCt方法表示的相对定量和基因绝对量的平行关系;
以上步骤为非诊断目的的方法。
3.检测权利要求1所述的LncRNAs生物标志物的引物,其特征在于,序列如下:
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