[发明专利]乳腺癌标志物及其应用

说明书

本申请涉及作为乳腺癌标志物的circRNA及其用途，所述circRNA选自circTADA2A‑E6、circTADA2A‑E5/E6、circNOL10、circNSUN2、circCSRNP2、circFAM125B、circCDC27和circABCC1。本发明还涉及用于乳腺癌诊断、预后和治疗的试剂盒、微阵列、药物以及相关的方法和用途。

技术领域

本发明涉及乳腺癌诊断、预后和治疗的组合物、方法和用途。具体 而言，本发明涉及与乳腺癌诊断、预后和治疗的circRNA分子、与之相 关的乳腺癌诊断、预后和治疗的试剂盒和微阵列、以及相关的方法和用 途。

背景技术

乳腺癌是一种常见的恶性肿瘤，在全球女性癌症发病率中位居第一。 近年来，中国的乳腺癌发病率和死亡率逐年上升，严重危及了中国女性 的健康。从分子改变与临床相关的角度来看，乳腺癌是一种复杂而多样 的疾病，应当被认为是一类分子水平各不相同的肿瘤。现今临床上乳腺 癌至少有4种分子亚型：Luminal A(ER+PR+Her2-)、Luminal B(ER+PR- Her2-)、Her2(ER-PR-和Her2+)和TNBC(ER-PR-和Her2-)。现如今， 生物标志物的检测也开始用于乳腺癌的预后和辅助化疗如21基因标记 (21-gene signature)(Oncotype DX)和欧洲普通70基因检测MammaPrint (European common 70-gene detectionMammaPrint)。因此，发现，鉴定并 对乳腺癌的生物标志物进行分组的研究是必须和重要的。

环状RNA(circRNA)据认为是由线性pre-mRNA非经典剪接成环状 形式所致。circRNA在进化上保守，在秀丽线虫(C.elegans)、斑马鱼、 果蝇、小鼠以及人类中circRNA结构稳定且丰度高。某些circRNA的丰 度高达其线性对应物的200倍。circRNA被确定是主要由外显子或内含 子产生的稳定结构，并且通过反向剪接(back splicing)或套索内含子(lariat intron)差异产生(differentially generated)，然后形成既无5’帽也无3’尾的共价闭合环结构。外显子circRNA在细胞中非常稳定，相比之下mRNA 的平均半衰期为10h，大多数种类的外显子circRNA半衰期超过48h。 外显子circRNA和内含子circRNA在调控基因表达中皆起作用。最近的 研究表明：circRNA可能通过以下几种方式发挥其生物学功能，如积极 参与pre-mRNA剪接、通过与蛋白结合影响基因表达、通过表观遗传调 控miRNA的海绵(epigenetic miRNA sponges)、RNA转运者、以及促进 其母体mRNA转录。迄今为止，超过10,000种人类circRNA已被发现， 广泛分布且多样化地存在于人类，通常具有组织特异性和发育期特异性， 与分子生物学和分子肿瘤学密切相关。

环状RNA(circRNA)作为广泛分布且多样化的、具有巨大调控效能 的内源非编码RNA，已有研究证明circRNA在若干类型的疾病(诸如动 脉粥样硬化和神经系统病症)的发生中发挥着重要作用。最近几年， circRNA在癌症中所起的作用和功能成为癌症研究领域的新焦点。 circRNA的独特特征不断地被揭示和发现，将扩展对癌症的认识，尤其 在癌症发生和癌的恶性发展方面。在人类癌症如食管癌、CRC和胃癌中 circRNA表达异常。circITCH在食管鳞状细胞癌中通过与miRNA如 miR-7、miR-17和miR-214相互作用显示出抗肿瘤功能。Ahmed等人通 过Ingenuity IPA工具试剂盒(QIAGEN Redwood City,www.qiagen.com/ingenuity)富集RNA发现了在乳腺癌或卵巢癌中差异表 达的312种circRNA。