[发明专利]基于细长反应腔的全基因组扩增方法有效
申请号: | 201710304056.X | 申请日: | 2017-05-03 |
公开(公告)号: | CN107058291B | 公开(公告)日: | 2020-08-25 |
发明(设计)人: | 涂景;陆祖宏;李俊吉;鲁娜;乔祎 | 申请(专利权)人: | 东南大学 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 南京苏高专利商标事务所(普通合伙) 32204 | 代理人: | 郑立发 |
地址: | 211189 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 细长 反应 基因组 扩增 方法 | ||
1.一种基于细长反应腔的全基因组扩增方法,其特征在于,将多重链置换扩增反应体系注入细长型的反应腔中,完成对目标基因组的全基因组扩增;所述的细长型的反应腔,反应腔中反应溶液所处的区域,区域总长度和反应腔内部平均横截面积的平方根之间的比值在5:1到2×106:1之间。
2.根据权利要求1所述的一种基于细长反应腔的全基因组扩增方法,其特征在于,所述的多重链置换扩增,是采用具有链置换能力的核酸聚合酶和随机序列引物,在恒温的条件下,对目标基因组核酸片段进行扩增,提高其绝对质量。
3.根据权利要求2所述的一种基于细长反应腔的全基因组扩增方法,其特征在于,所述的具有链置换能力的核酸聚合酶,包括Φ29DNA聚合酶,Klenow DNA聚合酶或Bst DNA聚合酶。
4.根据权利要求2所述的一种基于细长反应腔的全基因组扩增方法,其特征在于,所述的随机序列引物,其长度为5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39或40个碱基,其中包含一个或多个简并碱基。
5.根据权利要求2所述的一种基于细长反应腔的全基因组扩增方法,其特征在于,所述的随机序列引物,为普通未修饰引物,或者为经过硫代修饰、硫酸化修饰或氨基修饰的修饰引物。
6.根据权利要求1所述的一种基于细长反应腔的全基因组扩增方法,其特征在于,所述的细长型的反应腔,反应腔中反应溶液所处的区域,反应腔内部的平均横截面积在25平方微米到4平方毫米之间。
7.根据权利要求1所述的一种基于细长反应腔的全基因组扩增方法,其特征在于,所述的细长型的反应腔,反应腔的横截面为圆形、椭圆形、正方形或长方形,反应腔各部分的横截面相同或者不相同。
8.根据权利要求1所述的一种基于细长反应腔的全基因组扩增方法,其特征在于,所述的细长型的反应腔,反应腔是塑料、玻璃或金属材质的微细管道,或者是通过微加工工艺在微流控芯片中制备的细长形流道。
9.根据权利要求1所述的一种基于细长反应腔的全基因组扩增方法,其特征在于,所述的目标基因组,为一种或多种人类、动物、植物或微生物的基因组,目标基因组的规模,为单细胞基因组或多细胞基因组。
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