[发明专利]一种鸡传染性喉气管炎病毒的实时荧光定量PCR检测方法在审
申请号: | 201710184165.2 | 申请日: | 2017-03-24 |
公开(公告)号: | CN107099617A | 公开(公告)日: | 2017-08-29 |
发明(设计)人: | 张铁;陈谏;王春光;孟凡国;张广群;蒋桂娥;贾书芬;贾泽;张石磊 | 申请(专利权)人: | 河北农业大学 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68 |
代理公司: | 石家庄国为知识产权事务所13120 | 代理人: | 申超平 |
地址: | 071001 *** | 国省代码: | 河北;13 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 传染性 气管炎 病毒 实时 荧光 定量 pcr 检测 方法 | ||
1.一种鸡传染性喉气管炎病毒的实时荧光定量PCR检测方法,其特征在于包括如下步骤:
(1)引物设计:针对鸡传染性喉气管炎病毒的gB基因设计并合成了一对引物PF和PR,上游引物PF为5′- CAATGGCTTCGGAGAAAGAG-3′,下游引物PR为5′- GGCAATCCTGATCCCATCTA-3′;
(2)传统PCR扩增:首先对提取出对鸡传染性喉气管炎病毒DNA进行传统PCR扩增,通过预变性、变性、退火、延伸步骤,快速特异地在体外扩增出目的DNA片段;
(3)阳性标准品制作:将目的DNA片段连接入载体,转入感受态细胞,构建重组质粒作为阳性标准品;
(4)荧光定量PCR检测:用梯度稀释的质粒标准品进行real-time PCR扩增 ,得到扩增曲线,并以拷贝数为x轴,以Ct值为y轴,构建real-time PCR标准曲线,建立检测鸡传染性喉气管炎病毒的荧光定量PCR方法;
(5)对该引物进行了特异性和灵敏度检测。
2.根据权利要求1所述的鸡传染性喉气管炎病毒的实时荧光定量PCR检测方法,其特征在于步骤(3)中所述阳性标准品制作的步骤为:将PCR产物与pUC19-T载体25℃条件下连接,转化于DH5α感受态细胞中,37℃过夜培养,挑取单菌落,转于含有Amp的LB液体培养基中,37℃环境下,以200 r/min振荡培养12h,提取重组质粒,测序,用微量紫外可见分光光度计测定浓度和纯度,根据摩尔定律,计算出单位体积质粒所含的DNA拷贝数浓度,依据计算出的拷贝数进行10倍梯度稀释,作为标准品。
3.根据权利要求1所述的鸡传染性喉气管炎病毒的实时荧光定量PCR检测方法,其特征在于步骤(4)中所述荧光定量PCR检测的步骤为:用10倍梯度稀释的质粒标准品进行real-time PCR扩增 ,得到扩增曲线,并以拷贝数为x轴,以Ct值为y轴,构建real-time PCR标准曲线,建立检测鸡传染性喉气管炎病毒的荧光定量PCR方法。
4.根据权利要求1所述的鸡传染性喉气管炎病毒的实时荧光定量PCR检测方法,其特征在于步骤(1)中所述gB基因Gen Bank登录号为EU104985。
5.根据权利要求1所述的鸡传染性喉气管炎病毒的实时荧光定量PCR检测方法,其特征在于步骤(2)中所述传统PCR扩增的20μL的反应体系为:2×mix 10μL、25μmol/μL上游引物PF 0.5μL、25μmol/μL下游引物PR 0.5μL、模板DNA 2μL、ddH2O 7μL。
6.根据权利要求1所述的鸡传染性喉气管炎病毒的实时荧光定量PCR检测方法,其特征在于步骤(2)中所述反应条件为:94℃预变性5 min,94℃变性30s,60℃退火30 s,72℃延伸30s,循环30次;最后72℃延伸5 min。
7.根据权利要求1所述的鸡传染性喉气管炎病毒的实时荧光定量PCR检测方法,其特征在于步骤(4)中所述real-time PCR扩增的20μL的反应体系为:2×SYBR GreenⅠ qPCR Master Mix 10μL、25μmol/μL上游引物PF 0.5μL、25μmol/μL下游引物PR 0.5μL、模板DNA 2μL、ddH2O 7μL。
8.根据权利要求1所述的鸡传染性喉气管炎病毒的实时荧光定量PCR检测方法,其特征在于步骤(4)中所述real-time PCR扩增的反应条件为:95℃预变性10min,95℃变性10s,60℃退火30s,40℃延伸30s,共40个循环;扩增反应结束后加热至95℃变性15s,降至60℃保温1min,以0.1℃/s递增加热至95℃。
9.根据权利要求1所述的鸡传染性喉气管炎病毒的实时荧光定量PCR检测方法,其特征在于步骤(5)中所述特异性检测方法为:对提取出的病毒DNA 分别进行传统PCR和real-time PCR扩增,以ddH2O为阴性对照。
10.根据权利要求1所述的鸡传染性喉气管炎病毒的实时荧光定量PCR检测方法,其特征在于步骤(5)中所述灵敏度检测的方法为:将10倍梯度稀释的质粒标准品用引物分别进行传统PCR和real-time PCR扩增。
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