[发明专利]蚕豆根系蛋白质组学分析的样品制备方法有效

专利信息
申请号: 201710159164.2 申请日: 2017-03-17
公开(公告)号: CN106908402B 公开(公告)日: 2020-03-24
发明(设计)人: 李萍;刘玉皎 申请(专利权)人: 青海大学
主分类号: G01N21/31 分类号: G01N21/31;G01N1/28;G01N1/34
代理公司: 北京天奇智新知识产权代理有限公司 11340 代理人: 李树志
地址: 810016 *** 国省代码: 青海;63
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摘要:
搜索关键词: 蚕豆 根系 蛋白质 分析 样品 制备 方法
【权利要求书】:

1.蚕豆根系蛋白质组学分析的样品制备方法,其特征在于,包括以下步骤:

(1)取新鲜蚕豆根系;

(2)将所取样品置于预冷至-20℃的研钵内,用液氮快速冷冻并充分研磨至细粉;

(3)研磨好的粉末中加入10倍体积酚抽提液,不定时涡旋混匀等待20min后,加入等体积的Tris平衡酚饱和溶液pH8.0,4℃放置30min,期间每5min摇晃混匀一次;离心后收集上层酚液;

(4)向步骤(3)所述的上层酚液中加入预冷的0.1mol/L醋酸铵-甲醇溶液,-20℃沉淀过夜后,离心收集沉淀;

(5)步骤(4)所述的沉淀中加入5倍体积的预冷甲醇,轻微混合后,4℃离心,弃上清液,沉淀中加入预冷丙酮,轻微混合,4℃离心,收集沉淀;

(6)步骤(5)所得的沉淀真空干燥至水分≤8%,得粉末;

(7)步骤(6)所得粉末溶解液于样品裂解液,23℃下放置3h以上,期间涡旋混匀2~3次;

(8)裂解结束后,离心取上清液,上清液再次离心,取上清液作为待分析溶液;

(9)绘制标准曲线,取待分析的上清液与考马斯亮蓝蛋白试剂反应,测定吸光值,根据标准曲线测定待分析溶液中蛋白质的浓度;

样品蛋白浓度μg/μl=X/样品体积μl;

样品蛋白含量Xμg=(Y-0.0108)/0.015;

式中,X为样品蛋白含量,Y为样品的吸光值;

(10)按根系蛋白总上样量200μg,上样总体积 350μl,计算蛋白体积,并分装后-80℃保存;

样品蛋白体积μl=200μg/样品蛋白浓度

(11)从-80℃取出蛋白样品,自然溶解后按上样总体积 350μl和蛋白体积,计算出水化液体积,加入蛋白样品水化液,离心,即得蚕豆根系蛋白质组学分析样品;

水化液体积=350μl-蛋白体积;

步骤(3)中所述的酚抽提液为0.7mol/L蔗糖、0.1mol/LNaCl、0.5mol/L Tris-HClPH7.5、50mmol/L EDTA-2Na和0.2%DTT的混合溶液;所述的离心条件为5000×g,10min;

步骤(4)中加入的醋酸铵-甲醇溶液的量为上层酚液体积的5倍;预冷至-20℃。

2.根据权利要求1所述的蚕豆根系蛋白质组学分析的样品制备方法,其特征在于,步骤(4)中所述的离心条件为12000×g,10min。

3.根据权利要求1所述的蚕豆根系蛋白质组学分析的样品制备方法,其特征在于,步骤(5)中所述的离心条件都为12000×g,10min。

4.根据权利要求1所述的蚕豆根系蛋白质组学分析的样品制备方法,其特征在于,步骤(7)中所述的样品裂解液为8mol/L尿素、2%聚乙二醇辛基苯基醚、60mmol/L二硫苏糖醇的混合溶液。

5.根据权利要求4所述 的蚕豆根系蛋白质组学分析的样品制备方法,其特征在于,步骤(9)中蛋白浓度标准曲线以牛血清蛋白为标准蛋白,以Bradford方法绘制。

6.根据权利要求5所述的蚕豆根系蛋白质组学分析的样品制备方法,其特征在于,步骤(9)中所述考马斯亮蓝蛋白试剂包括:质量浓度为0.01%的考马斯亮蓝G-250,质量浓度为4.75%的乙醇和质量浓度为8.5%的磷酸;反应时间为5min,检测波长为595nm。

7.根据权利要求6所述的蚕豆根系蛋白质组学分析的样品制备方法,其特征在于,步骤(11)中所述蛋白样品水化液包括:7mol/L尿素,2mol/L硫脲,4%CHAPS,65mmol/L二硫苏糖醇,0.2%载体两性电解质和0.001%溴酚蓝。

8.根据权利要求7所述的蚕豆根系蛋白质组学分析的样品制备方法,其特征在于,步骤(8)和步骤(11)中的离心条件均为4℃、20000×g下离心20min。

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