[发明专利]蚕豆根系蛋白质组学分析的样品制备方法有效
申请号: | 201710159164.2 | 申请日: | 2017-03-17 |
公开(公告)号: | CN106908402B | 公开(公告)日: | 2020-03-24 |
发明(设计)人: | 李萍;刘玉皎 | 申请(专利权)人: | 青海大学 |
主分类号: | G01N21/31 | 分类号: | G01N21/31;G01N1/28;G01N1/34 |
代理公司: | 北京天奇智新知识产权代理有限公司 11340 | 代理人: | 李树志 |
地址: | 810016 *** | 国省代码: | 青海;63 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 蚕豆 根系 蛋白质 分析 样品 制备 方法 | ||
1.蚕豆根系蛋白质组学分析的样品制备方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)取新鲜蚕豆根系;
(2)将所取样品置于预冷至-20℃的研钵内,用液氮快速冷冻并充分研磨至细粉;
(3)研磨好的粉末中加入10倍体积酚抽提液,不定时涡旋混匀等待20min后,加入等体积的Tris平衡酚饱和溶液pH8.0,4℃放置30min,期间每5min摇晃混匀一次;离心后收集上层酚液;
(4)向步骤(3)所述的上层酚液中加入预冷的0.1mol/L醋酸铵-甲醇溶液,-20℃沉淀过夜后,离心收集沉淀;
(5)步骤(4)所述的沉淀中加入5倍体积的预冷甲醇,轻微混合后,4℃离心,弃上清液,沉淀中加入预冷丙酮,轻微混合,4℃离心,收集沉淀;
(6)步骤(5)所得的沉淀真空干燥至水分≤8%,得粉末;
(7)步骤(6)所得粉末溶解液于样品裂解液,23℃下放置3h以上,期间涡旋混匀2~3次;
(8)裂解结束后,离心取上清液,上清液再次离心,取上清液作为待分析溶液;
(9)绘制标准曲线,取待分析的上清液与考马斯亮蓝蛋白试剂反应,测定吸光值,根据标准曲线测定待分析溶液中蛋白质的浓度;
样品蛋白浓度μg/μl=X/样品体积μl;
样品蛋白含量Xμg=(Y-0.0108)/0.015;
式中,X为样品蛋白含量,Y为样品的吸光值;
(10)按根系蛋白总上样量200μg,上样总体积 350μl,计算蛋白体积,并分装后-80℃保存;
样品蛋白体积μl=200μg/样品蛋白浓度
(11)从-80℃取出蛋白样品,自然溶解后按上样总体积 350μl和蛋白体积,计算出水化液体积,加入蛋白样品水化液,离心,即得蚕豆根系蛋白质组学分析样品;
水化液体积=350μl-蛋白体积;
步骤(3)中所述的酚抽提液为0.7mol/L蔗糖、0.1mol/LNaCl、0.5mol/L Tris-HClPH7.5、50mmol/L EDTA-2Na和0.2%DTT的混合溶液;所述的离心条件为5000×g,10min;
步骤(4)中加入的醋酸铵-甲醇溶液的量为上层酚液体积的5倍;预冷至-20℃。
2.根据权利要求1所述的蚕豆根系蛋白质组学分析的样品制备方法,其特征在于,步骤(4)中所述的离心条件为12000×g,10min。
3.根据权利要求1所述的蚕豆根系蛋白质组学分析的样品制备方法,其特征在于,步骤(5)中所述的离心条件都为12000×g,10min。
4.根据权利要求1所述的蚕豆根系蛋白质组学分析的样品制备方法,其特征在于,步骤(7)中所述的样品裂解液为8mol/L尿素、2%聚乙二醇辛基苯基醚、60mmol/L二硫苏糖醇的混合溶液。
5.根据权利要求4所述 的蚕豆根系蛋白质组学分析的样品制备方法,其特征在于,步骤(9)中蛋白浓度标准曲线以牛血清蛋白为标准蛋白,以Bradford方法绘制。
6.根据权利要求5所述的蚕豆根系蛋白质组学分析的样品制备方法,其特征在于,步骤(9)中所述考马斯亮蓝蛋白试剂包括:质量浓度为0.01%的考马斯亮蓝G-250,质量浓度为4.75%的乙醇和质量浓度为8.5%的磷酸;反应时间为5min,检测波长为595nm。
7.根据权利要求6所述的蚕豆根系蛋白质组学分析的样品制备方法,其特征在于,步骤(11)中所述蛋白样品水化液包括:7mol/L尿素,2mol/L硫脲,4%CHAPS,65mmol/L二硫苏糖醇,0.2%载体两性电解质和0.001%溴酚蓝。
8.根据权利要求7所述的蚕豆根系蛋白质组学分析的样品制备方法,其特征在于,步骤(8)和步骤(11)中的离心条件均为4℃、20000×g下离心20min。
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