[发明专利]乳腺癌预后相关基因突变检测试剂盒及其使用方法

说明书

本发明公开了一种用于检测与乳腺癌预后相关基因突变的试剂盒，所述试剂盒包括检测GFOD2、KCNK9和MAP2易感SNP位点基因型的试剂，所述SNP位点具体信息如表1所示。本发明进一步公开了一种用于检测与乳腺癌预后相关基因突变的生物制剂。本发明筛选了三个易感基因的SNP位点在乳腺癌诊断、预后中的应用前景，阐述SNP对于乳腺癌进展的影响，揭示其在诊断、预后中价值。因此，本发明可开发出利用SNP基因型对乳腺癌的预后进行检测的试剂盒和生物制剂，不仅能够快速有效的做到早期诊断、预后评估，其精确度大大提高，而且为基因治疗、药物治疗等临床应用提供了治疗靶点和重要依据。

技术领域

本发明涉及生物医学技术领域，具体涉及乳腺癌预后相关基因突变检测试剂盒及其使用方法。

背景技术

乳腺癌是一种全身性疾病、其发生和发展是一个涉及多因素、多环节的复杂过程，包括癌基因的激活以及抑癌基因的失活等。因此，基因突变在乳腺癌的发生、发展过程中起着非常重要的作用。

乳腺癌是一个多因素遗传变异性疾病，只有不足10％是由于单基因缺陷引起的。随着高通量基因技术的发展，越来越多与乳腺癌相关基因被发现，这些基因上潜在的遗传变异(单核苷酸多态和拷贝数变异)可能引起乳腺癌药物治疗效果的差异。由于遗传变异的存在使抗肿瘤药物的代谢途径以及药物作用的目标基因可能受到影响，进而影响疗效以及预后。

SNP(singlenucleotidepolymorphism，SNP，即单核苷酸多态性)是1996年由美国麻省理工学院的人类基因组研究中心学者Lander提出的一类分子遗传标记，主要是指基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。SNP表现出的多态性仅涉及到单个碱基的变异，表现是有转换、颠换、插入和缺失等。单核苷酸多态性为第三代遗传标志，人体许多表型差异、对药物或疾病的易感性等等都可能与SNP有关。目前对于不同分型乳腺癌预后、疗效的预测性研究主要集中在SNP水平。

SNP赋予个体对环境暴露、药物治疗等的不同反应，从而产生不同的表型，因此SNP可能是导致个体疾病发生发展差异的重要遗传基础。利用疾病易感的SNP谱诊断疾病，具有快速、灵敏、准确等特点，因而应用前景广阔。近年来，利用SNP诊断疾病的发生发展已成为临床和科研工作者的研究热点。

GFOD2(Homo sapiens glucose-fructose oxidoreductase domaincontaining2，葡萄糖果糖还原酶2)是蛋白编码基因，位于16号染色体，具有氧化还原酶活性。参与细胞外基质的组成、氧化还原过程。有相关研究表明GFOD2基因的多态性位点(rs12449157)与高胆固醇血症相关。

KCNK9(potassium two pore domain channel subfamily K member 9，酸敏感性钾离子通道蛋白)，位于8号染色体该基因编码一个包含多个跨膜区域和两个孔形成P结构域的蛋白质，并具有pH依赖性钾通道的功能。这种基因的扩增和过度表达已被发现在几种类型的癌症中。该基因印迹于大脑中，从母体等位基因中得到优先表达。这个基因的突变与Birk Barel精神发育迟滞的畸形综合征相关。是多转录变异体的选择性剪接结果。

MAP2(microtubule associated protein 2，微管相关蛋白2)，位于2号染色体，该基因编码一种属于微管相关蛋白家族的蛋白。这个家族的蛋白质参与微管的组装，是神经发生的一个重要步骤。在大鼠和小鼠中相似基因的表达产物是神经元特异性的细胞骨架蛋白，具有丰富的树突结构，在神经元发育过程中稳定树突状结构具有重要的作用。并且，一些剪接变异体编码不同的亚型已被发现。

然而，目前还没有将GFOD2、KCNK9和MAP2基因的SNP位点应用于乳腺癌诊断和预后的报道，若能筛选出与乳腺癌预后相关的SNP作为预测指标，并研制相应的预后试剂盒，将对乳腺癌个体化治疗产生重要指导意义，并为其药物筛选及药效评价开辟新的途径。

发明内容